アメリエフ / アメリエフ ID: J01952

RNA-seq解析 ID: J01952

サービスについて

サービス内容

【RNAシーケンス】
  • ライブラリ調製
  • Illumina社 NovaSeq6000による(PolyA 4Gb/13.3Mペアエンドリード、non stranded RNA-seq)シーケンシング
  • *4Gbを超える場合や、strand specific RNA-seqをご希望の場合はお問合せください

【バイオインフォマティクス解析】fig.1
  • 解析レポート、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション、結果データ一式の納品)
  • 発現定量解析:マッピング、 発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析
  • 二群間の発現量比較解析:Volcano plot
     * サンプル数によって対応可能な組み合わせ数が異なります。統計的な解析には 各群3サンプル以上必要です。
  • エンリッチメント解析:Gene Ontology解析、パスウェイ解析 (Reactome)

アメリエフが選ばれる理由

実験と解析をワンパッケージでご提供します
研究目的にあった解析手法を選択し解析プランを組み立てます
解析内容と解析結果を丁寧にご説明し仮説検証に貢献します



RNAシーケンス サンプル要件/注意事項

サンプルタイプ:total RNA
総量(ng) 液量(µL) 濃度(ng/μL) RIN値 純度
200以上 10以上 20以上 4.0以上
with flat base line
OD260/280 = 1.8~2.2
OD260/230 ≥ 1.8
no degradation,no contamination

* サンプルQCでRNA総量またはRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます。
* シーケンシングはシンガポールにて実施します。
* 海外輸送費・ 納品にかかる費用 (クラウドまたはHDD) を別途頂戴します。
* ヒトおよびマウス、ラット以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
* 本サービスは6サンプル以上から承ります。



バイオインフォマティクス解析 供与物

  • FASTQデータ
  • サンプル情報
  • 生物種
  • 比較の組み合わせ情報

納品物

下記に加え、目的に応じて実施した高次解析の結果を納品いたします。
  • データ解析結果報告書(PDF)
  • 発現変動解析結果ファイル(XLSX)
  • Volcano plot(PDF)
  • ヒートマップ(PDF)

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

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