サービス仕様
- シーケンシング：NovaSeq X Plus
- 納品データ：fastqファイル形式
- 納品方法：データダウンロード（100Gb未満）
ライブラリー調製方法
- NEBNext® UltraTM DNA Library Prep Kit
PCR-freeのメリットとデメリットについて
- PCR-freeのメリット
・PCRエラーやバイアスを無視できます。
・Duplication Rateが低く、ターゲット領域で、均一なカバレッジが得られることが期待できる。
- PCR-freeのデメリット
・お送りいただくDNA量が多く必要となる。
PCRありの場合：300ng以上（最低量）
PCRフリーの場合：1.5µg以上（最低量）
対して、PCRありの場合は、PCRエラーの影響を受ける可能性がありますが、PCR-freeよりも、少量のサンプル量からご依頼いただくことが可能です。
詳細については、サンプル要件の項をご確認ください。
解析メニュー（オプション）
MBWGデータ解析
クリーンデータ
クリーンデータ（CatNo. NV-CLEAN）をご依頼いただくと、以下の作業を行います。
1）オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。
2）低質リード（Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード）の除去。
＊Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。
3）塩基配列不明(N)が10％を超えるリードの除去。
＊クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
＊クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。
