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マクロジェン・ジャパン / コスモ・バイオ ID: J00521

トランスクリプトームシーケンシング ID: J00521

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様々なプラットフォームを用いた新規トランスクリプトーム解析を行えます

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サービスについて

概要（fig.1）

  • トランスクリプトームシーケンシングでは、RNA 解析によりサンプル間の 発現量の差 （Expression profile） を見ることができ、リファレンスデー タベースがない種でも新規トランスクリプトーム解析を行えます。
  • 21～23個のヌクレオチドで構成されている非翻訳領域の small RNA （small non-coding RNA） が siRNA や miRNA として作用するメカニ ズムはよく知られています。

fig.1 Technology pipeline for Transcriptome

データ解析（＊）（fig.2）

  • Transcriptome data analysis
    ・Standard data analysis
    　- de novo Assembly / Alignment and Statistics
    　- Gene expression profile
    　- Differentially Expressed Genes（DEGs）
    　- SNPs and Indel calling by mapping to reference genome
    ・Advanced data analysis
    　- Gene Annotations / Gene Set Analysis
    　- Comparative analysis
    　- Customized analysis

  • Small RNA data analysis
    ・Small RNA data Analysis
    　- Expression Profiles, Novel smRNA, Differentially Expressed miRNA
    　- Target Prediction of Known miRNA
    　- Gene Set Analysis
    　- Comparative analysis


fig.2 Technology pipeline for small RNA Sequencing
　＊ Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.

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参考価格・納期

サービス項目 RNA-seq small RNA-seq
使用機種 NovaSeq 6000 or NovaSeq X plus HiSeq2500
対象生物 ヒト、マウス、ラット等 ヒト、マウス、ラット等
データ量 4 Gb or 6Gb (リード数：4,000 万) 1 レーン使用：約 8 Gb
リード長 100 bp or 150bp 50 bp
シーケンス方法 Paired End Single End
必要サンプル量 Total RNA 1 µg 以上(mRNA Library Prep)
Total RNA 0.5 µg 以上(Total RNA Library Prep)		 Total RNA 3 µg 以上
価格（税抜）
  • ライブラリ作製およびシーケンス
    TruSeq®stranded mRNA Library Prep. Kit
    真核生物用(PolyAキャプチャー対応でのmRNA-Seq仕様)
    ￥40,000/サンプル

    TruSeq® stranded Total RNA Library Prep. Kit with RiboZero Plus kit
    ヒト・マウスなどの哺乳類、バクテリアなどの微生物解析用
    ￥51,000/サンプル
  • データ解析(Human,MouseのDEG解析）
    ￥16,000/サンプル（＊1）
  • ライブラリー作製：￥51,000
    （TruSeq Small RNA Library Prep Kit使用）
    1 レーン：￥215,000
  • データ解析：￥49,000
納期（QC合格後） 約 4～6 週間 約 8 週間（データ解析まで）
納品物
  1. シーケンシング結果（fastq）
  2. サンプル間の発現レベル比較結果
  1. シーケンシング結果（fastq）
  2. サンプル間の発現レベル比較結果

＊1 Human、Mouseサンプルで5比較以上は追加費用が必要となります。

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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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