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株式会社薬研社

ID: J01208
ID: J01208
ベックス / ベックス

微生物シークエンス(微生物同定)

日本薬局方準拠の「遺伝子解析による微生物の迅速同定法」に基づき、微生物の解析を行います。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 塩基配列解析(シーケンス解析)・ゲノム変異解析 > 微生物同定・推定解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 塩基配列解析(シーケンス解析)・ゲノム変異解析 > DNAシーケンス解析

サービスについて

特長

  • 日本薬局方準拠の「遺伝子解析による微生物の迅速同定法」に基づき、微生物の解析を行います。
  • 細菌に対しては、16S rRNAの高度可変領域の一部または全長、真菌に対しては18S rRNA と5.8S rRNA間のスペーサー領域(ITS1)をPCR増幅後、シークエンス解析を行ないます。
また、ベックスでは1営業日で解析結果を報告するオプションサービスもご用意しております。

微生物シークエンス(微生物同定)に使用するプライマー

プライマー名 配列
細菌同定プライマー 10F 5’-GTTTGATCCTGGCTCA
800R 5’-TACCAGGGTATCTAATCC
真菌同定プライマー ITS1F 5’-GTAACAAGGT(T/C)TCCGT
ITS1R 5’-CGTTCTTCATCGATG
細菌全長解析用プライマー 27F 5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG
1492R 5’-GGCTACCTTGTTACGACTT

納品内容

  • 波形データ(PDF)
  • 塩基配列(テキスト形式)
  • BLAST検索の結果(登録配列と一致率の高い上位10個の菌名)
  • 作業報告書(郵送)

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

■微生物シークエンス(微生物同定)

サービス項目 価格(税抜) 納期
細菌あるいは真菌 DNA抽出~PCR増幅~シークエンス~BLAST検索 ¥15,000/サンプル 約1週間
不明
細菌、真菌の判断がご依頼以前に
ご不明の場合の解析となります。
¥20,000/サンプル 約1週間
全長解析(細菌のみ) ¥28,000/サンプル 約1週間

* サンプル数、受注状況により納期が前後することがございます。

■オプション

サービス項目 価格(税抜) 納期
超特急・微生物同定 +¥30,000/サンプル 1営業日

* サンプルが午前中に弊社へ到着した営業日を0カウントとし、翌営業日のご報告となります。
* 受注状況により当オプションはご利用できない場合がございます。事前にお問い合わせください。
* 当オプションにつき、最長3営業日以上の納期を頂戴せざるを得なくなった場合は、料金は頂戴いたしません。

・ベックスでは、試料の単離作業は行っておりません。純粋培養された菌株からの受け入れとなります。
・病原性を有する可能性のある菌株の受け入れは行っておりません。
・PCRはDNA抽出も含め、最大2回まで行いますが、2回目でも産物が得られない場合は作業中止とさせていただきます。
・微生物シークエンスを2回行っても明確な波形が得られず、解析不能塩基数がベックスの出荷基準値を上回った場合は、
 定価の半額を頂戴いたします。
・ベックスでは菌種同定判断までは対応しておりません。得られたBLAST検索結果よりお客様にご判断していただくことになります。
・お送りいただいたサンプルは機密保持に基づき厳重に処分いたします。
・サンプルをお送りいただく際、送料はお客様ご負担となります。


関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。