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株式会社薬研社

ID: J01785
ID: J01785
アメリエフ / アメリエフ

シングルセルRNAデータ解析システム

10x Genomics社のChromiumを使用した、シングルセルRNA解析向けに構成したサーバー・サービスを提供いたします。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【RNAシーケンス】 > Single cell-Seq解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代データマイニング

サービスについて

サービス概要

Chromiumを使用したシングルセルRNA解析を始めたいが、どのようなサーバーが良いかわからない ・シングルセル解析に合ったツールをインストール・動作確認したサーバーを提供いたします
シングルセルRNA解析を始めたいが、Linuxを使用した解析に慣れていない ・シングルセルRNA解析に使用するソフトウエアのマニュアルをご提供し、利用方法を解説
導入後も、解析・システム両面からサポートしてほしい ・サーバーの設置、ネットワーク接続まで実施いたします
・サーバー操作のお困りごとをサポートいたします
・解析手法の選定・データ解釈をサポートいたします(オプション)

サーバー・サービス詳細

高スペックのサーバーに、シングルセルRNA-seq解析に必要なソフトウェアをインストールして納めますので、すぐに解析を始めることが可能です。
全プラン共通でアメリエフ独自のサーバーシステムサポートが含まれます。

サービス 内容
サーバ本体 解析目的と10xGenomics社各種機種に合った3種類のモデルからご選択いただけます。
ソフトウエア導入
利用方法の解説
対象ソフトウェア
【10x社製解析ソフトの導入支援】Cell Ranger、Space Ranger、Loupe Browser
【高次解析ソフト導入】R、Seurat、Monocle

ソフトウエアマニュアルのご提供と利用方法の解説
シングルセルRNA解析の高次解析で使用するソフトウエアのマニュアルをご提供し、利用方法の解説を行います。
【アメリエフ独自】
サーバーシステム
サポート
オープンソースソフトウエアの利用を支援するサポート 12ヶ月
サーバーに導入した解析ソフトウエアの利用方法に関するご相談やシステムトラブルを受け付け、対応するサービスです。
* オープンソースソフトウエア自体のバグ修正等は本サービスの対応範囲外となります。
HWオンサイト保守 ハードウエア故障時のサポート 36ヶ月
・サーバー障害時に製品の設置場所まで訪問・修理を行う保守サービスです。

サーバーモデル詳細

解析目的と10xGenomics社対応機種に合った3種類のモデルからご選択いただけます。

モデル サーバー構成例 特徴 10xGenomics社
対応機種
スタンダードプラン CPU: Xeon Silver (2.1GHz、12core) × 1
メモリ: 128GB
SSD:1TB(OS)
HDD: 8TB×4(RAID6)
OS: Ubuntu 20.04 LTS
シングルセルRNA-seq解析を実行可能な解析サーバーです。
解析に必要なソフトの動作要件を満たしています。
Chromium
Controller
スタンダードプラスプラン CPU: Xeon Gold (3.1GHz、16core) × 1
メモリ: 256GB
SSD:1TB(OS)
HDD: 12TB×5(RAID6)
OS: Ubuntu 20.04 LTS
シングルセルRNA-seq解析を高速に実行できる解析サーバーです。
研究を効率化するための中程度のスペックのマシンとしてご提案しています。
Chromium
Controller
Chromium
Xシリーズ
ハイスペックプラン CPU: Xeon Gold (3.1GHz、16core) × 2
メモリ: 512GB
SSD: 2TB(OS)
HDD: 12TB×5(RAID6)
OS: Ubuntu 20.04 LTS
シングルセルRNA-seq解析や、Visiumを使用した空間的遺伝子発現解析を実行できるサーバーです。
大規模なラボで多数の解析を行う環境としてご提案しています。
Chromium
Controller
Chromium
Xシリーズ

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス項目 価格 納期
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関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。