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ID: E01351
タカラバイオ / タカラバイオ

高速シーケンス(NGS)解析

最新技術を用いた高速・大量シーケンス(NGS)
新規ゲノム・変異解析・ChIP・16S rRNAの網羅的解析に


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > Whole Genome解析(全ゲノム解析)
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > RNA-Seq解析・TruSeq(微量)トランスクリプトーム解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > エクソーム解析

サービスについて

特長

  • 各種次世代シーケンサーを用いたハイスループットな塩基配列解析
  • 幅広いアプリケーションに対応
  • サンプル処理×情報解析をトータルにサポート
  • 国内設備と安心のセキュリティ体制

概要

次世代シーケンサーであるNovaSeq / HiSeq / MiSeq(イルミナ社)、Ion PGMシステム(サーモフィッシャーサイエンティフィック社)およびPacBio RS II(パシフィックバイオサイエンス社)を用いて、高速シーケンス(NGS)解析サービスを提供いたします。
大量のシーケンス解析が可能であるため、新規ゲノムのドラフト解析、変異解析をはじめ、転写産物解析やメタゲノム解析など用途に応じて最適な機種を用いて解析いただけます。

サービス内容

  • NovaSeq / HiSeq / MiSeqによる解析
    物理的に断片化したDNAからライブラリーを作製してフローセルに結合させ、Sequencing by Synthesis法による2色または4色蛍光検出により塩基配列を一挙に解析します。NovaSeqの場合、一度に1フローセルあたり約2,400Gbの塩基配列データの取得が可能です。ゲノム配列解析だけでなく、RNA-seq解析に対するプラットフォームが整っています。
  • Ion PGMシステムによる解析
    断片化したDNAからライブラリーを作製してemulsion PCR法により増幅し、マイクロチップ上でシーケンス反応および検出を行います。
    DNAが伸長する際に放出される水素イオン濃度を半導体チップ上で検出し塩基配列に変換します。およそ800Mbまでの塩基配列データを一度に取得することが可能です。Cancer PanelなどマルチプレックスPCRにより増幅したPCR産物の変異解析などが注目を集めています。
  • PacBio RS IIによる解析
    物理的に断片化した長鎖DNAからライブラリーを作製して、1分子リアルタイム(Single Molecule Real-Time; SMRT)DNAシーケンスを行います。長鎖の解析リード長を誇り、10kbのシーケンスデータを得ることが可能です(P6/C4試薬)。また、1分子を鋳型にシーケンスを行うため、増幅バイアスを無くすことができます。新規ゲノム配列解析だけでなく、スプライシングバリアントの検出目的としてcDNA配列解析などにも有効です。
  • GridION X5による解析
    物理的に断片化した長鎖DNAから作製したライブラリーを、タンパク質微細孔(ナノポア)を通過する際に生じるイオン電流変化を計測することによって塩基配列を検出します。この新技術により、10kb以上の長鎖リードを解析できます。また、GridION X5は一度に5フローセル(1フローセルあたり約3~6Gbaseの塩基配列データを取得)を並列にシーケンスできるため、ハイスループットな解析が可能です。非モデル生物の新規ゲノム解析だけでなく、従来型の次世代シーケンサーでは解析が困難な染色体構造変異解析などに期待ができるシーケンサーです。
機器の特長
NovaSeq6000
(S2試薬使用)
NovaSeq6000
(S4試薬使用)
HiSeq 2500
(*Rapid Mode)
HiSeq 2500
(SBS v4試薬使用)
PacBio RS II GridION X5
1リード長 100 base 150 base 100 / 150 / 250 base 100 / 125 base 約10,000 base 約5,000~15,000 base
リード数 約26億リード
(1レーンあたり)*1
約40億リード
(1レーンあたり)*1
約2.5億リード
(1レーンあたり)*1
約4億リード
(1レーンあたり)*1
約7.5万リード
(1セルあたり)
約30~100万リード
(1フローセルあたり)
データ量 約262 Gb
(1レーンあたり)*1
約600 Gb
(1レーンあたり)*1
約25/37.5/62.5 Gb
(1レーンあたり)*1
約40/50 Gb
(1レーンあたり)*1
約750 Mb
(1セルあたり)
約3~6 Gbase
(1フローセルあたり)
解析手法 Sequencing by Synthesis法 SMRT*2
sequencing法
Nanopore
Sequencing法
解析単位 ・1レーンから
・相乗り
・1レーンから ・1レーンから
・相乗り
・1セルから ・1フローセルから
アプリケーション例 ・エクソーム解析
・RNA-seq解析
・全ゲノムシーケンス解析
・エクソーム解析
・RNA-seq解析
・ゲノム変異解析
・mRNA解析
・cDNA配列解析
・ゲノム配列解析
・cDNA配列解析
・ゲノム配列解析
・全ゲノム解析
Ion PGMシステム Ion GeneStudio S5 MiSeq
Ion 318 chip Ion 540 chip
1リード長 ~200 base ~200 base 150 / 250 / 300 base
リード数 約400万リード (1ランあたり) 約7,000万リード (1ランあたり) 約3,000万リード (1ランあたり)*1
データ量
(リード長 200 baseの場合)
約800Mb(1チップあたり) 約12.5 Gbase(1チップあたり) 約4.5~9Gb (1ランあたり)*1
解析手法 Ion semiconductor sequencing法 Ion semiconductor sequencing法 Sequencing by Synthesis法
解析単位 ・1チップから ・1チップから ・1ランから
アプリケーション例 ・癌遺伝子などの変異解析
(50遺伝子をターゲットとしたCancer Panelなど)
・癌遺伝子などの変異解析
(400遺伝子をターゲットとしたCancer Panelなど)
・微生物の新規ドラフト配列決定
・癌遺伝子などの変異解析
・PCR産物のディープシーケンス

*1 ペアエンド解析を行います。
*2 SMRTはSingle Molecule Real-Timeの略になります。

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納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式(塩基配列情報、精度情報)
  • 各種アプリケーションに適したデータ解析結果
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受入サンプル

各種アプリケーションによって異なりますので、お問い合わせください。
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ご注文に関して

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製品カタログ・リーフレット

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参考価格・納期

サービス項目 価格 納期
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関連サイト

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※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
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