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株式会社薬研社

ID: J01528
ID: J01528
日本ジェネティクス / 日本ジェネティクス

次世代シーケンス解析サービス ギガ読み

ライブラリー調製まではお客様に行っていただき、NGSのシーケンス解析のみを受託するサービスです。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析

サービスについて

概要

「ギガ読み」は、ライブラリー調製までをお客様自身に行っていただき、“シーケンス解析のみ”を受託するサービスです。
相乗りシーケンスにて行っているため、ライブラリー調製からご依頼いただくよりも、とても安価にシーケンスを行うことができます。
取得するデータ量もお客様自身で設定することができるため、データの少量取得から大規模なシーケンスまで、幅広いニーズに対応することが可能です。

【ギガ読みサービスをご利用いただく際の注意事項】
illumina Truseqキットのアダプター配列と、同じアダプター配列となるライブラリーの場合は、ギガ読みをお申し込みいただけません。
この場合、レーンシーケンスサービスへの変更、もしくはライブラリーの再調製をお願いする場合がございます。ご了承ください。

サービス仕様と推奨ライブラリーサイズ

サービス
メニュー
サービス仕様 推奨ライブラリーサイズ
Library size
(insert + adapter (120 bp) +/- 50 bp)
NV-PE150 ギガ読み(PE150)
*1Gbあたり
シーケンシング:illumina NovaSeq6000/PE150
納品データ:fastqファイル形式
納品方法:データダウンロード(100Gb未満)、HDD納品(100Gb以上)
320bp~520bp
NV-PE250 ギガ読み(PE250)
*1M PEリードあたり
シーケンシング:illumina NovaSeq6000/PE250
納品データ:fastqファイル形式
納品方法:データダウンロード(100Gb未満)、HDD納品(100Gb以上)
400bp~650bp
NV-PE50 ギガ読み(PE50)
*1M PEリードあたり
シーケンシング:illumina NovaSeq6000/PE50
納品データ:fastqファイル形式
納品方法:データダウンロード(100Gb未満)、HDD納品(100Gb以上)
90~110bp
インデックスに規定があり、8 bp(i7)+16 bp(i5)のみ相乗りが可能です。
全長が123 bpを超えるとフローセルシーケンスでのみの対応となります。
NV-SE50 ギガ読み(SE50)
*1M リードあたり
シーケンシング:illumina NovaSeq6000/SE50
納品データ:fastqファイル形式
納品方法:データダウンロード(100Gb未満)、HDD納品(100Gb以上)
130 bp~650 bp

クリーンデータ(オプション)
クリーンデータ(CatNo. NV-CLEAN)をご依頼いただくと、以下の作業を行います。

1)オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。
2)低質リード(Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード)の除去。
* Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。
3)塩基配列不明(N)が10%を超えるリードの除去。

*クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
*クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。

サンプル要件

  • データ量< 20G の場合:サンプル液量≥ 15µL
  • データ量30G<X≤100Gの場合:サンプル液量 ≥ 25µL
  • データ量100G<X<400Gの場合: サンプル液量≥ 50µL
  • ライブラリー濃度:≥2ng / µL

単一のメインピークで複数のピークがない、アダプターの汚染がない、プライマーダイマーがないこと


ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
次世代シーケンス解析サービス ギガ読み お問い合わせ ライブラリ―QC合格後15営業日
(プール数が多く、データ量が少ない場合は要相談)

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。