概要

「ギガ読み」は、ライブラリー調製までをお客様自身に行っていただき、“シーケンス解析のみ”を受託するサービスです。
相乗りシーケンスにて行っているため、ライブラリー調製からご依頼いただくよりも、とても安価にシーケンスを行うことができます。
取得するデータ量もお客様自身で設定することができるため、データの少量取得から大規模なシーケンスまで、幅広いニーズに対応することが可能です。

【ギガ読みサービスをご利用いただく際の注意事項】
illumina Truseqキットのアダプター配列と、同じアダプター配列となるライブラリーの場合は、ギガ読みをお申し込みいただけません。
この場合、レーンシーケンスサービスへの変更、もしくはライブラリーの再調製をお願いする場合がございます。ご了承ください。

サービス仕様と推奨ライブラリーサイズ

サービス メニュー	サービス仕様		推奨ライブラリーサイズ Library size (insert + adapter (120 bp) +/- 50 bp）
NV-PE150	ギガ読み（PE150） ＊1Gbあたり	シーケンシング：illumina NovaSeq6000/PE150 納品データ：fastqファイル形式 納品方法：データダウンロード（100Gb未満）、HDD納品（100Gb以上）	320bp～520bp
NV-PE250	ギガ読み（PE250） ＊1M PEリードあたり	シーケンシング：illumina NovaSeq6000/PE250 納品データ：fastqファイル形式 納品方法：データダウンロード（100Gb未満）、HDD納品（100Gb以上）	400bp～650bp
NV-PE50	ギガ読み（PE50） ＊1M PEリードあたり	シーケンシング：illumina NovaSeq6000/PE50 納品データ：fastqファイル形式 納品方法：データダウンロード（100Gb未満）、HDD納品（100Gb以上）	90～110bp インデックスに規定があり、8 bp(i7)+16 bp(i5)のみ相乗りが可能です。 全長が123 bpを超えるとフローセルシーケンスでのみの対応となります。
NV-SE50	ギガ読み（SE50） ＊1M リードあたり	シーケンシング：illumina NovaSeq6000/SE50 納品データ：fastqファイル形式 納品方法：データダウンロード（100Gb未満）、HDD納品（100Gb以上）	130 bp～650 bp

クリーンデータ（オプション）
クリーンデータ（CatNo. NV-CLEAN）をご依頼いただくと、以下の作業を行います。

1）オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。
2）低質リード（Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード）の除去。
＊ Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。
3）塩基配列不明(N)が10％を超えるリードの除去。

＊クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
＊クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。

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サンプル要件

• データ量< 20G の場合：サンプル液量≥ 15µL
• データ量30G＜X≤100Gの場合：サンプル液量 ≥ 25µL
• データ量100G＜X＜400Gの場合： サンプル液量≥ 50µL
• ライブラリー濃度：≥2ng / µL

単一のメインピークで複数のピークがない、アダプターの汚染がない、プライマーダイマーがないこと