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ZYMO RESEARCH / フナコシ ID: J01519

ChIP-Seq Service ID: J01519

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次世代シークエンサーによるChiP解析受託サービス

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サービスについて

概要

次世代シークエンサーを使用したクロマチン免疫沈降試料の解析（ChIP-Seq）受託サービスです。ChIP（Chromatin immunoprecipitation）の実施からライブラリーの構築、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析まで一貫したサービスをご提供します。

特長（fig.1）

  • ヒストン修飾、タンパク質―DNA相互作用に関するゲノムワイドな網羅解析や、タンパク質結合部位の同定に有用です。
  • 最適化されたワークフローと、解析方法のカスタマイズにより、高品質なデータをご提供します。
  • ご提供いただいた試料を用いて、Zymo Research社が最適化したクロマチンの断片化および濃縮技術を用いてChIPアッセイを行います。その後、ChIP-Seq用のライブラリーを構築し、シークエンシング、解析を行います。
  • Illumina社の次世代シークエンサーHiSeqを用いてシークエンシングを行います。
  • ご自身でChIPアッセイを行い、試料DNAを送付していただくことも可能です。
  • 少量の試料からでも解析可能です。

fig.1 H3K4ME3特異的抗体を用いたChIP-Seq結果。本サービスの解析結果により示されたヒストン修飾領域と、ENCODEプロジェクトで明らかにされた領域が一致した。

サービス概要（fig.2）


fig.2 サービス概要

解析例

  • ChIP-Seqで得られた染色体上のピーク（fig.3）
  • ChIP-Seqで得られた遺伝子の平均的なプロファイル（fig.4）
  • ピークコーリング（ゲノム上のタンパク質結合部位と結合量の解析図）（fig.5）

fig.3 ChIP-Seqで得られた染色体上のピーク

fig.4 ChIP-Seqで得られた遺伝子の平均的なプロファイル

fig.5 ピークコーリング（ゲノム上のタンパク質結合部位と結合量の解析図）

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参考価格・納期

サービス名 価格（税抜） 納期
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  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
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  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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