受託オンライン
Commissioned Research Online

受託オンライン
株式会社薬研社

ID: J01474
ID: J01474
富士フイルム和光純薬 / AnnoRoad

次世代シーケンス受託サービス

Illumina社の各機種、Pacific Biosciences社のPacBio Sequel Systemなどを保有しています。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ロングリード シーケンス (1分子シーケンス)】 > 一分子リアルタイムDNAシーケンス
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > 16S-rRNA アンプリコン解析(細菌叢解析)
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > Whole Genome解析(全ゲノム解析)
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > de Novoシーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > メタゲノム解析・メタトランスクリプトーム解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【RNAシーケンス】 > RNA-Seq解析・TruSeq(微量)トランスクリプトーム解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > エクソーム解析

サービスについて

概要

AnnoRoad社とは・・・・
2012年に中国北京、南京、義烏市にシーケンス拠点が設立された遺伝子解析会社です。研究用NGSサービス用に最新装置を導入しています。
また、中国国内ではイルミナ社との共同開発専用装置の供給を受けて体外診断事業を行っています。

保有機種

Miseqシリーズから、上位機種であるHiseq Xシリーズ、最新機種のNovaSeq6000を保有。
また、Pacific Bioscience社のPacBio Sequel Systemを保有しております。

MiSeq シリーズ
HiSeq シリーズ
HiSeq X シリーズ
NovaSeq6000
PacBio Sequel System

PacBioシーケンス

  • 特長
    ・従来のシーケンサーと比較し、圧倒的に長いリード(最大60kbp)が取得可能
    ・ライブラリー作製時にPCRを行わないため、GCバイアスの影響がない
    ・超ロングロード解析により、リピート領域全体を決定することが可能
  • 活用方法
    ・逆位、転座等の大規模な構造多型の解析
    ・完全長cDNAの同定や新規転写産物、アイソフォーム、新規スプライシング様式の検出

    ショートリードの解析では繰り返し配列などがあると正確に転写産物を再現できず、完全長cDNAシーケンスには限界がありました。
    PacBioのロングリードシーケンスでは1つのリードでmRNA分子全体を網羅することができるため、多様なアイソフォームの解析が可能になりました。

検体推奨条件

全ゲノムシーケンス エクソームシーケンス
サンプルの状態 タンパク質除去・RNase 処理後のゲノムDNA サンプルの状態 タンパク質除去・RNase 処理後のゲノムDNA
DNA量 ≥1μg DNA量 ≥300ng
容量 30μL 容量 10μL
濃度 ≥37ng/μL 濃度 ≥37ng/μL
OD260/280 1.8~2.2 OD260/280 1.8~2.2
OD260/230 1.8~2.2 OD260/230 1.8~2.2
RNA-Seq(ヒト、マウス) RNA-Seq(その他動物)
サンプルの状態 タンパク質除去・DNase 処理後の Total RNA サンプルの状態 タンパク質除去・DNase 処理後の Total RNA
RNA量 ≥2μg RNA量 ≥2μg
容量 30μL 容量 30μL
濃度 ≥65ng/μL 濃度 ≥150ng/μL
OD260/280 1.8~2.2 OD260/280 1.8~2.2
OD260/230 1.8~2.2 OD260/230 1.8~2.2
28S:18S ≥1.2 28S:18S ≥1.2
RIN ≥7 RIN ≥6.5
RNA-Seq(植物・真菌) PacBio シーケンス(DNA)
サンプルの状態 タンパク質除去・DNase 処理後の Total RNA サンプルの状態 タンパク質除去・RNase 処理後のゲノム DNA
RNA量 ≥5μg RNA量 ≥8μg
容量 30μL 容量 15μL
濃度 ≥250ng/μL 濃度 ≥80ng/μL
OD260/280 1.8~2.2 OD260/280 1.8~2.0
OD260/230 1.8~2.2 OD260/230 1.6~2.5
28S:18S ≥1.2 QC/NC 0.5~2.0
RIN ≥6.5 DNA 鎖長 メインバンドが 30Kbp 以上
備考 不溶性物質は含まないようお願いします。
サンプルは高温環境下、極端なpH環境下にて
保管しないようお願いします。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

【Illumina機種 参考価格】
ご依頼検体数に応じてボリュームディスカウントをさせていただきます。

mRNA-Seq(Eukaryotes)
サービス名 データ量 リード数 価格(税抜)
(1~4検体ご依頼)
価格(税抜)
(5~9検体ご依頼)
価格(税抜)
(10検体以上ご依頼)
mRNA-seq(150bp PE) 3G 1,000万リード ¥45,000 ¥35,000 ¥27,000
6G 2,000万リード ¥60,000 ¥45,000 ¥36,000
9G 3,000万リード ¥75,000 ¥60,000 ¥45,000
12G 4,000万リード ¥90,000 ¥75,000 ¥54,000

* 納期:AnnoRoad社にサンプル到着後25営業日~(I検体の発送に別途2週間ほど必要です。)

全エクソームシーケンス(SureSelect Human ALL Exon V6)
サービス名 データ量 カバレッジ 価格(税抜)
(1~4検体ご依頼)
価格(税抜)
(5~9検体ご依頼)
価格(税抜)
(10検体以上ご依頼)
ヒトエクソ-ム解析
(150bp PE)
6G 100×カバレッジ相当 ¥80,000 ¥70,000 ¥56,000
12G 200×カバレッジ相当 ¥115,000 ¥90,000 ¥80,500

*納期:AnnoRoad社にサンプル到着後25営業日~(検体の発送に別途2週間ほど必要です。)

全ゲノムシーケンス
サービス名 データ量 カバレッジ 価格(税抜)
(1~4検体ご依頼)
価格(税抜)
(5~9検体ご依頼)
価格(税抜)
(10検体以上ご依頼)
ヒトゲノム解析(150bp PE) 90G 30×カバレッジ相当 ¥178,000 ¥170,000 ¥160,000

*納期:AnnoRoad社にサンプル到着後20営業日~(検体の発送に別途2週間ほど必要です。)

【PacBioシーケンス 参考価格】

サービス名 内容 価格(税抜)
ライブラリー調製費用(PacBio シーケンス) 1ライブラリー ¥80,000/検体
シーケンス費用 (PacBio シーケンス) SMRTcell(≥5Gb/cell) ¥288,000/検体
new SMRTcell(≥12Gb/cell) ¥512,000/検体

*納期:別途ご相談ください。

・データ返却はFastqデータでの納品となります。
・ハードディスク媒体での納品をご希望の場合、別途費用(¥20,000(税抜))が必要です。
 (HDD納品ご希望の場合、HDDの発送に別途1週間ほど必要です。)
・検体は精製済みDNA / RNAからお受け致します。
・検体は富士フイルム和光純薬からAnnoRoad社へ発送します。発送に別途2~3週間ほど必要です。
・QCをクリアできなかった検体については初回のみ無償再送付を対応致します。
 * 検体の再送付についてはQC結果連絡後3週間以内にお願いします。
   3週間を過ぎてご連絡がない場合はそのまま解析・清算に進ませていただきます。。

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。