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QIAGEN QIAseq Targeted DNA Panels

概要

QIAGEN社のQIAseq Targeted DNA Panels は、がん遺伝子のエクソン領域およびホットスポット領域をPCR増幅し、 次世代シークエンサーを用いて高感度に遺伝子変異を検出します。 11種類のがんパネルから目的に応じてご選択頂けます。また、カスタムパネルを作製して、解析を行うことも可能です。

解析内容

• 11種類のがんパネルから目的に応じてご選択頂けます
• カスタムパネルの作製が可能
• FFPEサンプルからの解析にも対応します
• 分子バーコードにより、正確で高感度な変異解析

解析の流れ（fig.1）

疾患パネルラインアップ

Actionable solid tumor panel	ヒトの20個のがん遺伝子における主要な領域及び3個の腫瘍抑制遺伝子の全エクソン領域を解析
BRCA1 and BRCA2 panel	ヒトの乳がんおよび卵巣がんの発症と進行に関連するBRCA1およびBRCA2における変異を解析
BRCA1 and BRCA2 Plus panel	ヒトの乳がんおよび卵巣がんの発症と進行に関連するBRCA1、BRCA2を含む6遺伝子における変異を解析
Breast cancer panel	ヒト乳がんの発症と進行に関連した93遺伝子における変異を解析
Colorectal cancer panel	ヒト大腸がんの発症と進行に関連した71遺伝子における変異を解析
Lung cancer panel	ヒト肺がんの発症と進行に関連した72遺伝子における変異を解析
Mitochondrial panel	ヒトミトコンドリアゲノムにおけるコードおよび非コード領域の体細胞変異を解析
Myeloid Neoplasms panel	ヒト骨髄性腫瘍の発症と進行に関連した143遺伝子における変異を解析
Pharmacogenomics panel	ヒトの個々における薬物や他の化学物質における代謝能力に関連する31個のハプロタイプの薬物代謝関連遺伝子における変異を解析
Comprehensive cancer panel	ヒトの包括的ながんの発症と進行に関連する275遺伝子およびTERTプロモーターにおける変異を解析
Lnherited diseases panel	ヒト遺伝性疾患に関連する298遺伝子における変異を解析（有害で高頻度に見られる劣性の遺伝性疾患に関係する164遺伝子を含む）

＊ 各パネルの搭載遺伝子についてはこちらをご覧ください。

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サンプル送付について

通常DNA

DNA量	濃度	OD260/280	OD260/230	性状
200ng以上	50ng/μL以上	1.5以上	1.0以上	分解が進んでいないこと

FFPE DNA

DNA量
200ng以上	＊ DNAチップ研究所でQIAseq QuantiMIZE kitsによる FFPE DNA-QCを実施します

• サンプルはNuclease Free Waterに溶解し、DNAチップ研究所へご送付ください。
• 必ずRNase処理を行ってください
• DNAの濃度測定は、picogreenなどによる2本鎖DNA定量を行ってください
• サンプルは、冷凍便（冷凍状態）にてDNAチップ研究所へお送り下さい
• 分解が進んだサンプルでは、正確なデータが得られない可能性があるため、事前に分解がないことを確認していただく必要があります。電気泳動写真（またはコピー）を添付してください
• 分解が進んだサンプルでの解析をご希望の場合は、必ず予めご相談下さい
• サンプル量が上記に満たない場合でも解析は可能ですが、必ず予めご相談ください