サービス仕様
- シーケンシング:NovaSeq X Plus
- 納品データ:fastqファイル形式
- 納品方法:データダウンロード(100Gb未満)
ライブラリー調製方法
Ribo-Zero にて、rRNAを除去した後に、 NEBNext Ultra Directional RNA LP Kitでストランド特異的ライブラリーを調製します。
データ解析(オプション)
標準データ解析
クリーンデータ
クリーンデータ(CatNo. NV-CLEAN)をご依頼いただくと、以下の作業を行います。
1)オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。
2)低質リード(Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード)の除去。
* Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。
3)塩基配列不明(N)が10%を超えるリードの除去。
*クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
*クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。