概要

PacBio Sequel lle で取得する「HiFiリード」は、長くて（10～15kb）、美しい（精度が99%以上）です。そのため、ショートリードを用いた従来法に比べ、コンティグの数は圧倒的に少なく、ギャップが生まれにくく、完全長ゲノムDNAを目指す場合に非常に有効な手段です。

サービス内容

• 送付サンプルのDNA濃度測定（蛍光法による2本鎖DNAの定量・吸光度によるDNAの定量・電気泳動）
• シーケンスライブラリー作製
• シーケンシング解析（PacBio Sequel lleを用いてHiFiリードを取得）
• アセンブル（オートアノテーション含む）＊ 原核生物の場合のみ

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ご提供サンプル

ご提供いただくDNAの量と品質がとても大事です。

1. DNA量
   濃度50ng/マイクロL以上、総量 4μg以上
   ＊ ゲノムサイズ300Mb以上の真核生物の場合は、濃度50ng/μL以上で、1セルごとに4μg以上のDNAが必要です。
   ＊ DNA濃度・総量が基準未満の場合は、「微量DNA対応」のオプションがございます。
2. DNAの品質
   受入れ後の電気泳動装置（Fragment Analyzer）を用いた品質確認でGQNが5以上であること。
   ＜お客様で事前に確認する場合＞
   260/230は2.0以上、260/280 は 1.8以上、電気泳動で20kb以上にバンドが見えていることが望ましいです。
3. バッファー
   ヌクレアーゼ活性を抑えてDNA分解を抑えられるTE bufferがお勧めです。
4. 送付方法
   保管時と同じ温度帯（冷蔵or冷凍）でお送りください。
   また、輸送中の大きな揺れによる物理的なせん断を避けるために、梱包の際はサンプルチューブを緩衝材で包んでご送付ください。DNA抽出からご依頼いただくことも可能です。生物技研ホームページオプションをご覧ください。

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納品物

以下のデータをDVDやUSB等の記録媒体に保存して納品します。

• 報告書
• シーケンス生データ（fastq形式）
• DDBJのデータベース登録に必要なデータ
• アセンブルおよびオートアノテーションデータ ＊原核生物の場合のみ