ID: J00520
ID: J00520
コスモ・バイオ / マクロジェン・ジャパン
エクソーム / ターゲットシーケンシング
エキソンを効率的にキャプチャーし、遺伝子翻訳領域およびUTRを選択的にシーケンシング
カテゴリ
シーケンス（塩基配列）解析 > 次世代シーケンス（NGS）解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス（塩基配列）解析 > 次世代シーケンス（NGS）解析【ゲノムDNAシーケンス】 > エクソーム解析
サービスについて
概要（fig.1）
- Human Exome Sequencingでは、エキソンを効率的にキャプチャーし、遺伝子翻訳領域およびUTRを選択的にシーケンシングします。（一部動物も可。）
- Targeted Sequencingでは、目的の領域をキャプチャーできるCustomized Kitを製作してシーケンシングします。
プラットフォーム / キャプチャーキット
- HiSeq / MiSeq system（Single, Paired-end）
- Capture Kit
・llumina Nextera
・Agilent SureSelect
・Nimblegen SeqCap EZ
お客様のご要望によっては、別のCapture kitもご利用頂けます。
データ解析（fig.2）
- Exome / Target data analysis
・Standard data analysis
- Mapping to the current plant reference genome
- Analysis of mapping statistics
- SNPs and Indel calling
- Variant annotation
・Advanced data analysis
- Comparative analysis
- Disease analysis
ご注文に関して
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参考価格・納期
| サービス項目 | Exome Sequencing |
|---|---|
| 使用機種 | Novaseq 6000 |
| 対象生物 | ヒト、マウス等 |
| データ量 | 7～18Gb |
| リード長 | 150bp |
| ライブラリ作製 | SureSelect V6（Human）または SureSelect Mouse |
| シーケンス方法 | Paired End / Multiplex |
| 必要サンプル量 | gDNA 1μg以上（分解なし、A260/A280は1.7以上） |
| データ解析 |
|
| 価格（税抜） | シーケンス費用（ライブラリ作製込み）： マウス 7Gb：￥61,000/サンプル（1～4 サンプル時） ヒト 7Gb：￥46,000/サンプル（1～4 サンプル時） ヒト 9Gb：￥51,000/サンプル（1～4 サンプル時） ヒト 18Gb：￥69,000/サンプル（1～4 サンプル時） データ解析（SNP）：￥16,000/サンプル |
| 納期（QC合格後） | 6～8週間 |
| 納品物 |
|
関連サイト
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