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株式会社薬研社

ID: J00520
ID: J00520
コスモ・バイオ / マクロジェン・ジャパン

エクソーム / ターゲットシーケンシング

エキソンを効率的にキャプチャーし、遺伝子翻訳領域およびUTRを選択的にシーケンシング


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > エクソーム解析

サービスについて

概要(fig.1

  • Human Exome Sequencingでは、エキソンを効率的にキャプチャーし、遺伝子翻訳領域およびUTRを選択的にシーケンシングします。(一部動物も可。)

  • Targeted Sequencingでは、目的の領域をキャプチャーできるCustomized Kitを製作してシーケンシングします。

プラットフォーム / キャプチャーキット

  • HiSeq / MiSeq system(Single, Paired-end)
  • Capture Kit
    ・llumina Nextera
    ・Agilent SureSelect
    ・Nimblegen SeqCap EZ

  • お客様のご要望によっては、別のCapture kitもご利用頂けます。

データ解析(fig.2

  • Exome / Target data analysis
    ・Standard data analysis
     - Mapping to the current plant reference genome
     - Analysis of mapping statistics
     - SNPs and Indel calling
     - Variant annotation
    ・Advanced data analysis
     - Comparative analysis
     - Disease analysis

  * Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目 Exome Sequencing
使用機種 Novaseq 6000
対象生物 ヒト、マウス等
データ量 7~18Gb
リード長 150bp
ライブラリ作製 SureSelect V6(Human)または SureSelect Mouse
シーケンス方法 Paired End / Multiplex
必要サンプル量 gDNA 1μg以上(分解なし、A260/A280は1.7以上)
データ解析
  • Variant Calling(SNP、In/Del)
  • Annotation
価格(税抜) シーケンス費用(ライブラリ作製込み):
 マウス 7Gb:¥61,000/サンプル(1~4 サンプル時)
 ヒト 7Gb:¥46,000/サンプル(1~4 サンプル時)
 ヒト 9Gb:¥51,000/サンプル(1~4 サンプル時)
 ヒト 18Gb:¥69,000/サンプル(1~4 サンプル時)
データ解析(SNP):¥16,000/サンプル
納期(QC合格後) 6~8週間
納品物
  1. シーケンシング結果(fastq)
  2. リファレンスゲノムへのマッピング結果
  3. クオリティコントロール結果
  4. ターゲット領域におけるdepth(冗長度)のヒストグラム
  5. SNV解析結果
  6. シーケンシングdepth(冗長度)とCCDSエクソンのカバレッジ解析結果

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
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