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マクロジェン・ジャパン / コスモ・バイオ ID: J00523

マイクロアレイ受託解析サービス：SNPジェノタイピング ID: J00523

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Illumina社のOmniSeriesによるSNPタイピングサービスです。

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サービスについて

Illumina社のOmniSeriesによるSNPタイピングサービスです。Illumina社の OmniSeriesは500Kまでカスタムのマーカーを追加することが可能ですので、同時にゲノムワイドのSNPスクリーニングと検証を可能にします。また、マクロジェンでは、複雑かつ大量のデータから重要なマーカーを発見するSNP関連解析サービスの提供も可能です。

各社アレイの特長

  illumina
Whole Genome SNP Custom Array
対応可能な種 Human ご希望をご連絡ください
使用するアレイ Human Omniシリーズ ご照会ください
特長 ・検証済のライブラリ
・ サンプルあたりの価格が低い
・1,000ゲノムとHapMapプロジェクトのデータを用いたコンテント選択
・ 1サンプルあたり最大450万マーカーまで同時に解析可能
 ご照会ください

i-SelectHD
・大量のマーカーのアッセイが可能（3K-100万）
・フォーマット：4、12、24サンプル

解析内容

  • SNP分析（fig.1）
    ・IBDスコアによる関係性テスト
    ・主成分分析（PCA）による階層化評価
    ・連鎖不平衡（LD）およびハプロタイプ解析
    ・Single Based Association（PLINK）
    ・Gene Based Association（SKAT、Score-Seq 等）
    ・Family Based Association（TDT、FBAT）
    ・連鎖分析（Merlin）

  • CNV分析（fig.2）
    ・CNVセグメントデータ（cnv Partition）
    ・その他セグメントアルゴリズム（DNA copy、HMM 等）
    ・GC波長の相関解析
    ・CNV領域の定義とサマリー
    ・CNV領域群集解析
    ・ゲノム多型データベース（DGV）によるマッピング

  • カスタム解析
    ・プロッティングの追加、アノテーション等


fig.1 SNP分析

fig.2 CNV分析

ご送付いただくDNAのQC基準

プラットフォーム サンプルタイプ QC 条件 その他
純度 (A260/280) 純度 (A260/230) 濃度 (ng/uL) 総量 (ug)
illumina ゲノム DNA >1.5 >1.0 >20ng/µL >0.25µg 分解・増幅がないこと

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

＊ 解析を含まないサービスのご注文の際は、品番末尾に「W」を入れて下さい（例： MAG-0016W）

プラットフォーム 最低注文
サンプル数		 希望販売価格 品番※
解析含む 解析含まない
illumina SNP/CGH
Human
Human Omni2.5-8 v1.1
32
ご照会
ご照会
MAG-0016
Human Omni2.5Exome-8 v1.1
16
ご照会
ご照会
MAG-0017
Human Omni5-Quad
16
ご照会
ご照会
MAG-0018
Human Omni5 Exome
16
ご照会
ご照会
MAG-0019
Human OmniZhongHua-8 v1.0
16
ご照会
ご照会
MAG-0020
Human OmniExpress-24 v1.0
48
ご照会
ご照会
MAG-0021
Human OmniExpressExome V1.2
16
ご照会
ご照会
MAG-0022
Human Exome-24 v1.1
48
ご照会
ご照会
MAG-0023
HumanCore v1.0
24
ご照会
ご照会
MAG-0024
HumanCoreExome-24 v1.4
48
ご照会
ご照会
MAG-0025
Multi-Ethnic GWAS and Exome Array (MEGA)
16
ご照会
ご照会
MAG-0026
OncoArray-500K v1.0
48
ご照会
ご照会
MAG-0027
OmniZhongHua-8 v1.3
16
ご照会
ご照会
MAG-0109
Multi-Ethnic Global-8 v1.0
16
ご照会
ご照会
MAG-0110
Multi-Ethnic EUR/EAS/SAS-8 v1.0
16
ご照会
ご照会
MAG-0111
Multi-Ethnic AMR/AFR-8 v1.0
16
ご照会
ご照会
MAG-0112
Infinium QC Array-24 V1.0
48
ご照会
ご照会
MAG-0113
ImmunoArray-24 v2.0
48
ご照会
ご照会
MAG-0114
Infinium? Neuro Consortium Array
288
ご照会
ご照会
MAG-0115
Global Screening Array + Multi Diseases
24
ご照会
ご照会
MAG-0116
HumanPsychArray-24 v1.0
48
ご照会
ご照会
MAG-0028
Bovine
BovineSNP50 v2.0
48
ご照会
ご照会
MAG-0029
BovineLD v1.1
48
ご照会
ご照会
MAG-0030
Infinium? BovineLD v2.0
48
ご照会
ご照会
MAG-0117
BovineHD
16
ご照会
ご照会
MAG-0031
Canine
CanineHD
24
ご照会
ご照会
MAG-0032
Porcine
PorcineSNP60 v2
48
ご照会
ご照会
MAG-0033
Ovine
OvineSNP50
24
ご照会
ご照会
MAG-0034
Goat
GoatSNP50
48
ご照会
ご照会
MAG-0035
Maize
MaizeSNP50
48
ご照会
ご照会
MAG-0036
Potato
PotatoSNP80
24
ご照会
ご照会
MAG-0037
Soy bean
BARCSoySNP6k V2
192
ご照会
ご照会
MAG-0119
Tomato
TomatoSNP
24
ご照会
ご照会
MAG-0038
SolCAP Tomato array
48
ご照会
ご照会
MAG-0118

○ 標準納期

サンプルが Macrogen 社に到着しサンプル QC 完了後の標準納期は下記になります。

メーカー 標準納期
解析含む 解析含まない
illumina 社 約 4 週間 約 3 週間

＊繁忙期にチップの在庫がない場合は上記よりも長く納期がかかります。

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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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