概要

遺伝子の転写過程における後成的な調整メカニズムは、DNAメチル化やヒストン修飾が最もよく知られています。NGSを利用することで、そのメカニズムをより効果的に解析できます。

シーケンシングプラットフォーム

• HiSeq / MiSeq system （Single, Paired-end）

データ解析（＊）

• Methylation / MBD （Methyl-CpG Binding Domain） data analysis（fig.1）
  ・Standard data analysis
  　- Global Methylation Profiles
  　- Specific Methylation Profiles
  　- Differentially Methylation Regions （DMR）
  ・Advanced data analysis
  　- DMR-Associated Genes
  　- Gene Set Analysis
  　- Comparative Analysis
  
• ChIP（Chromatin Immuno Precipitation）data analysis（fig.2）
  ・Standard data analysis
  　- Enrichment Peak Profiles and Gene Annotation
  　- Differentially Enriched Peaks and Gene Annotation
  　- Multiple Alignment and Consensus Motif
  ・Advanced data analysis
  　- Gene Set Analysis
  　- Comparative Analysis
  

　＊ Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.