ID: J00519
ID: J00519
コスモ・バイオ / マクロジェン・ジャパン
ChIPシーケンシング
NGSを利用してメカニズムを効果的に解析
カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【エピゲノムシーケンス】 > DNAメチル化解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > ゲノム変異解析
サービスについて
概要
遺伝子の転写過程における後成的な調整メカニズムは、DNAメチル化やヒストン修飾が最もよく知られています。NGSを利用することで、そのメカニズムをより効果的に解析できます。シーケンシングプラットフォーム
- HiSeq / MiSeq system (Single, Paired-end)
データ解析(*)
- Methylation / MBD (Methyl-CpG Binding Domain) data analysis(fig.1)
・Standard data analysis
- Global Methylation Profiles
- Specific Methylation Profiles
- Differentially Methylation Regions (DMR)
・Advanced data analysis
- DMR-Associated Genes
- Gene Set Analysis
- Comparative Analysis
- ChIP(Chromatin Immuno Precipitation)data analysis(fig.2)
・Standard data analysis
- Enrichment Peak Profiles and Gene Annotation
- Differentially Enriched Peaks and Gene Annotation
- Multiple Alignment and Consensus Motif
・Advanced data analysis
- Gene Set Analysis
- Comparative Analysis
ご注文に関して
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参考価格・納期
サービス項目 | ChIP Sequencing | |
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対象生物 | リファレンスのある生物のみ | |
使用機種 | HiSeq 2500 | NovaSeq 6000 |
リード数 | 220~250 M リード | 26 Mリード (paired-end なので実質は 13 M リード) |
リード長 | 50bp | 150bp |
シーケンス方法 | Single End 1レーンに4~8サンプル | Paired-End |
必要サンプル量 | IPしたDNA(精製したDNA断片)の濃度は10ng/μL以上で10μL以上必要です。 sizeは500bp以下で300bp程度が適しています。 |
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データ解析 | ピーク解析 | |
価格(税抜) | ライブラリ作製:¥42,000/サンプル ¥210,000/1レーン ¥45,000/データ解析 |
ライブラリ作製:¥42,000/サンプル ¥16,000/1レーン ¥45,000/データ解析 |
納期(QC合格後) | シーケンス:6~8週間 データ解析:1~2週間 |
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納品物 |
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関連サイト
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