サービス仕様
Reduced representation bisulfite sequencing（RRBS）技術はあらゆる脊椎動物のゲノムスケールDNAメチル
化解析を1塩基単位の解像度で実施できる手法です。
本手法はバイサルファイト法の利点を有しながら、決定する塩基配列量を圧縮することで費用対効果の高い
データ取得が可能です。
ゲノムを制限酵素 MspI（ターゲット部位 CCGG）消化することにより、プロモーターやCpGアイランドを含
むCpG-rich部位が濃縮され重要なメチル化イベントを解析できます（ヒト由来サンプルで最大700万CpG
のカバレッジが得られます）。
独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得・解析を加え、結果をお手元
にお届けします。
特長
- CpG リッチ領域（5-mC）のメチル化状態を一塩基分解能で解析
- サンプル当たり低価格でご提供
- エピジェネティックバイオマーカー探索に最適
- ゲノム全体の CpG リッチ領域のメチル化パターンを取得可能
- ヒトで最大 700 万箇所の CpG サイトをカバー
- わずか 100 ng のゲノム DNA から解析可能
- UMI（Unique Molecular Identifier）technology を用い PCR duplicateを除去するため、正確な解析が可能
NGS 解析、バイオインフォマティクス及びメチローム、RNA-seq を含むマルチオミクスのモデリングにお
ける豊富な経験を基にサービスを提供します。
DNAメチル化RRBS解析の流れ
Step 1：ゲノムDNA 品質管理
・DNA濃度の測定
・DNA品質の評価
Step 2：ライブラリー調製
・MspI消化
・ライブラリー調製
・サイズの選択
・サンプルプーリング
・バイサルファイト変換
・ライブラリーの増幅とクリーンアップ
・RRBS Library Poolの品質管理
Step 3：シーケンシング（Illumina社プラットフォーム使用）
・ペアエンドリード、PE50
・1サンプル当たり平均40 million raw reads
・ヒト由来サンプルで平均700万CpG をカバー
バイオインフォマティクス解析
多彩な追加解析オプションを取り揃えています。
- スタンダード解析（標準で含まれます）
リファレンスゲノムへのアラインメント、メチレーションコール
- アドバンス解析
・示差解析
・示差遺伝子のアノテーション
・主成分分析
・GO解析
・パスウェイ解析
・機械学習解析
- 解析のカスタマイズ
RNA-seqなどと組み合わせたマルチオミクス解析や、上記にない解析法をご希望の場合はお気軽にご相談ください。
