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遺伝子発現マイクロアレイ解析 ID: J02280

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Agilentマイクロアレイを用いた遺伝子発現の網羅解析サービス。ヒト・マウスはスライド乗合解析にも対応。

カテゴリ

サービスについて

特長

高感度・高精度と性能面での評価が高いアジレントマイクロアレイを使用
サンプル品質検査からデータ解析まで全工程を自社で完結
アジレント社公式認定サービスプロバイダとして信頼のデータを取得
ヒト・マウスの小規模実験に対応したお得な乗合プランを提供

サービス内容

サンプル品質検査（fig.1）
NanoDrop、Bioanalyzer、またはTapeStationを使用して検体の品質評価を行います。基本料金には送付2回分まで含まれています。
マイクロアレイ実験（fig.2）
核酸サンプルの蛍光色素標識から、アレイスライドへのハイブリダイゼーション、Rawデータ取得まで全工程をサポートします。
基本解析（fig.3）
正規化（ノーマライズ）を行い、検体や群同士の比較による発現変動遺伝子を抽出します。ノーマライズ法や閾値は各実験データに合わせて調整します。

fig.1 サンプル品質検査

fig.2 マイクロアレイ実験

fig.3 基本解析

解析プラン

ヒト（SurePrint G3 Human GE 8x60K Ver.3.0）またはマウス（SurePrint G3 Mouse GE 8x60K Ver. 2.0）の解析を希望されるお客様に、以下の2種類の解析プランをご提供しています。他のアレイについては通常プランのみとなります。

通常プラン　納期：3週間
スライド単位で解析を行います。
サンプルの品質検査に合格し、アレイが入荷次第、納期を設定します。スピーディに解析結果を得たいお客様に最適です。

乗合プラン　納期：未定（最大３ヶ月）
8解析未満の少数検体の解析を希望するお客様向けのプランです。
スライド上の8アレイを他のお客様とシェアすることで、コストを抑えて解析を行います。
少数のサンプルをお得に解析したいお客様におすすめです。

必要サンプル

サンプルの種類	必要量	純度・状態
Total RNA	総量：500ng以上濃度：50ng/μL以上液量：10μL以上	A260/A280：1.8～2.0 A260/A230：2.0以上 Nuclease Free水に溶解

＊北海道システム・サイエンスではQIAGEN社 RNeasy Mini KitでのRNA抽出、および、RNase-Free DNase SetでのDNase処理を推奨しています。
＊ DEPC水は反応を阻害する恐れがあります。RNAは必ずNuclease Free水に溶解してください。

納品データ

品名	内容	形式	詳細
書面	・作業報告書	－	－
記録メディア・CD-R ・DVD-R ・USBメモリ	・Rawデータ	txt	アレイシステム（数値化ソフトウェア）から出力されるシグナルデータ
	・スライドスキャン画像	tif，bmp	スキャナで取得した画像。数値データ（Rawデータ）を得る元になるデータ
	・シグナルテーブル	xlsx	ノーマライズ済みシグナル値、検体比較の発現比（LogFC）、変動遺伝子のリスト、ベースライン補正値
	・ビジュアルサマリー	html	ボックスプロット、スキャッタープロット、相関解析、主成分分析、クラスター解析、サンプル情報
	・データ解説資料	pdf	Rawデータや解析データの解説資料
	・作業プロトコル	pdf	アレイ実験のプロトコル、実験～データ解析の条件値
	・サンプル品質検査結果	pdf	サンプル品質検査のレポート
	・作業報告書	pdf	書面の作業報告書のpdfデータ

＊北海道システム・サイエンスのデータ保管期間は納品後6ヶ月です。保管期間を過ぎたデータのお問い合わせや追加解析の際は、データをご提供いただく場合がございますので、データは大切に保管してください。

ご注文に関して

以下のファイルをご利用の上、お問い合わせフォームからご送付ください。

専用注文書類

遺伝子発現解析1カラー注文書 (Excel)

遺伝子発現解析2カラー注文書 (Excel)

参考価格・納期

サービス項目		価格（税抜）	納期
遺伝子発現アレイ解析	乗合プラン　1カラー	下記条件に適応後、3週間（最大3ヶ月）・サンプル品質検査合格・乗合サンプル集積	お問い合わせください
	乗合プラン　2カラー	下記条件に適応後、3週間（最大3ヶ月）・サンプル品質検査合格・乗合サンプル集積
	通常プラン　1カラー	下記条件に適応後、3週間・解析スライド入荷・サンプル品質検査合格
	通常プラン　2カラー	下記条件に適応後、3週間・解析スライド入荷・サンプル品質検査合格

＊サンプル品質検査料金は2回分（再送分）まで解析価格に含まれています。
＊納期はご注文内容（解析数）によって変動いたします。

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