概要

Empire Genomics社のホームページ上の検索フォームに、遺伝子の染色体上の番地情報を入力するだけで、簡単にその番地を含むBACクローンに対応するFISHプローブを取り扱っています。5色の蛍光標識が選択可能です。

RPCI BACクローン対応FISHプローブ（fig.1）（fig.2）

• RPCI-11は、ロズウェルパーク癌研究所（Roswell Park Cancer Institute）で構築された、ヒト男性ゲノム由来のBACクローンライブラリーで、pBACe3.6ベクターに組み込まれています。
• ヒトRPCI-11 BACクローンコレクションの全クローン遺伝子配列を合わせると、全ヒトゲノムの32.2倍の長さをカバーしています。

fig.1 RPCI BACクローン対応FISHプローブ

fig.2 RPCI BACクローン対応FISHプローブ
• 高感度かつ特異性の高いFISH用プローブです。RPCI BACクローンの検索フォーム（下記参照）で、対応したFISHプローブの検索が可能です。
• 対応するBACクローンの末端配列を認識します。
• aCGHアレイの結果の検証などにも有用です。
• 蛍光色素は下記の5色からお選びいただけます。
• 反応回数：10 reactions

蛍光色	品名	励起波長	蛍光波長	減衰係数
アクア	DEAC dUTP	431nm	480nm	50,000
グリーン	5-Fluorescein dUTP	496nm	520nm	85,000
ゴールド	5(6)-Carboxyrhodamine 6G dUTP	525nm	551nm	92,000
オレンジ	5-TAMRA dUTP	552nm	576nm	60,000
レッド	5-ROX dUTP	580nm	603nm	75,000

クローン検索方法

1. Empire Genomics社ホームページから、「Technical Resources」→「Find a BAC Clone」をクリックして、「CloneCentral Human BAC Clone Locator」にアクセスして下さい。Searchボックスに、ご希望の遺伝子のPositionやGene Nameなどを入力して検索して下さい。
2. 「Search by region」で検索した場合は指定の領域を一部または全部含むBACクローンが、「Search by gene」で検索した場合は入力したキーワードを含むBACクローンがリスト形式で表示されます。
3. クローンの詳細と、対応するFISHプローブの情報が表示されます。また、下部にそのクローンに一部または全部含まれる遺伝子の情報が表示されます。