Novogene / フィルジェン ID: J01945

シングルセルシークエンス 受託解析サービス ID: J01945

サービスについて

概要

本サービスでは、10x Genomics ChromiumシステムとIllumina NGSプラットフォームを組み合わせることで、シングルセル遺伝子発現、シングルセル免疫プロファイリング、シングルセルATAC を含む、高品質なエンドツーエンドシングルセルソリューションとサービスを提供しています。

  • シングルセル遺伝子発現:ヘテロな細胞集団から各細胞における細胞の異質性、新規ターゲット、バイオマーカーをプロファイリングします。
  • シングルセル免疫プロファイリング:単一細胞から、全長、ペアB細胞もしくはT細胞レセプター、抗原特異性、および遺伝子発現を解析します。
  • シングルセルATAC:クロマチンアクセシビリティをシングルセルレベルで解析し、細胞の種類や状態、遺伝子制御機構の理解を深めることができます。


特長

シングルセルシークエンスは、ヘテロな細胞サンプルにおけるトランスクリプトームの多様性を明らかにすることを意図しています。3’ および 5’ 遺伝子発現に関する深い洞察を提供し、シングルセルの解像度で細胞の違いを特徴づけます。
この分野での最新技術、10x Genomics ChromiumシステムおよびIllumina NGSプラットフォームを活用したシングルセルシークエンスソリューションのエンドツーエンドパッケージを提供しています。ハイスループット、高精度のシングルセルシークエンスサービスを、迅速な納期でご提供します。

解析の流れ

サンプル調整、ライブラリー調製、シークエンス、データQCから、バイオインフォマティクス解析まで、高品質でプロフェッショナルなサービスを提供します。各ステップは、高い科学水準と綿密な設計に則して実施され、高品質な研究成果を保証します。

【解析のワークフロー】
  1. サンプル調整
    ・サンプルQC
  2. シングルセルライブラリー調製
    ・ゲルビーズエマルジョン(GEM)生成とバーコード化
    ・GEM-RT 後の精製
    ・cDNA 増幅
    ・ライブラリー構築
    ・ライブラリーQC
  3. シークエンス(Illumina、PE150)
    ・データQC
  4. バイオインフォマティクス解析

サービスの仕様

シークエンスプラットフォーム Illumina NovaSeq 6000 シークエンスシステム
リード長 PE 150bp
推奨データ量 サンプルあたり生データで 50Gb
データ解析内容 ・10x シークエンスデータ処理およびQC
・高頻度で変動する遺伝子の同定
・細胞のサブポピュレーションの同定
・マーカー遺伝子の検出
・エンリッチメント解析およびマーカー遺伝子のアノテーション


サンプル条件

サービスタイプ サンプル量 細胞生存率
出張解析サービス(*1) 少なくとも50,000細胞 細胞生存率>80%
細胞サイズ<40μm
凍結細胞サービス バイアルあたり1,000,000細胞以上を凍結し、
少なくとも2本の1.5mlクライオバイアルをお送りください。
細胞生存率>85%
細胞サイズ<40μm

*1 出張解析サービスは、日本国内のみ承っております。
* 組織からの解析をご希望の場合にも、お問合せください。

ご注文に関して

参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
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