大規模の機能スクリーニングに威力を発揮するNGS検証されたカスタムライブラリー
| 1 | ライブラリーデザイン | 1～4日 | スクリーニングを成功させるためには、目的に適したライブラリーを設計することが重要です。ベクタービルダー社の専門チームは、エラーが起こらない効率的なクローニングを可能にし、様々なスクリーニングに適切なマーカーまたはバーコード配列を含む、かつ信頼性の高い結果を得るために高シグナル / ノイズ比を実現できるライブラリーベクターのデザインをサポートしています。研究ニーズに応じて、s レンチウイルス、AAV、アデノウイルス、非ウイルス性プラスミド、piggyBacなど、多様なデリバリーシステムを選択できます。 CRISPRやRNAiスクリーンにおいて、標的遺伝子やゲノム領域のリストに対するgRNAやshRNA配列のデザインサポートが必要であれば、ベクタービルダーは確立したアルゴリズムと計算パイプラインを用いて、それらをデザインするお手伝いをいたします。2ベクターCRISPRライブラリーの場合、スクリーニング戦略に適した Cas9発現ベクター を構築して、ウイルスにパッケージングすることも受託しています。 |
| 2 | オリゴ合成 | 2～3週 | プール型ライブラリークローニング ベクタービルダー社はオリゴDNA新規合成、定性進化または両者を組み合わせて変異DNA配列バリアントを作製し、ライブラリーベクターにクローニングしています。変異DNA配列バリアントは最小限のPCRサイクルで増幅され、目的のベクターバックボーンに高カバレッジで同時並行クローニングされます。得られたライブラリーDNAは大腸菌に導入され、対数増殖期にある培養細胞を回収してグリセロールストックを作製します。ウイルスパッケージングを始める前にライブラリーDNAのカバレッジと均一性を検証するためにNGSを行います。 |
| 3 | ライブラリークローニング | 2～3週 | |
| 4 | NGS検証 | 1～2週 | |
| 5 | プール型ライブラリーの ウイルスパッケージ |
1～2週 | 目的細胞へライブラリーを導入するために、レンチウイルスやAAVを用いたウイルストランスダクションが必要かもしれません。ベクタービルダー社は独自技術と試薬を用いることによって、均一性を維持したままプール型ライブラリーDNAを高タイター、高純度でパッケージングすることができます。そのうえ、スクリーニングに用いることができるライブラリーウイルス液を短い納期でお届けできます。 |
| 6 | In vitro or in vivo スクリーニング |
プロジェクト 依存 |
ライブラリーを用いたハイスループットスクリーニングは、遺伝子機能解析、医薬品開発のための標的同定、パスウェイ解析、遺伝子マーカーや表現型の検出など幅広い用途のために、膨大なライブラリーを効率的にふるいにかける分析手法です。ベクタービルダー社の専門チームは、細胞生存性 / 生存スクリーニング、薬剤耐性スクリーニング、パスウェイスクリーニング、ターゲットベーススクリーニング、毒性スクリーニング、および特定の研究目的へのカスタムスクリーニングなど、特定の研究ニーズに合わせた、in vitroおよびin vivoの多様なプール型スクリーニングのオプションを提案することができます。 |
| 7 | NGSデコンボリューション | 3～5週 | ベクタービルダー社は、お客様のスクリーニングサンプルのNGS解析によるヒットの同定をお手伝いいたします。ベクタービルダー社にサンプルのゲノムDNAを送っていただければ、NGSライブラリーの調製、ハイスループットシーケンスの実施、データ解析、各サンプルの正確なリードカウントをわずか数週間でお届けします。 |
| サービス内容 | 説明 | 価格（税抜） | 作業日数 |
|---|---|---|---|
| ライブラリーデザイン | CRISPR、RNAi、バーコード、エンハンサー / プロモーター、変異導入、AAVキャプシドなどのプール型ライブラリーのベクターバックボーンの設計、および一般的なモデル生物ゲノム内の標的遺伝子 / 領域のgRNAまたはshRNA配列設計 | 無料 | 1～4日 |
| プール型ライブラリー作製クローニング（オリゴ合成とNGS検証を含む） | ご希望のベクターバックボーンに大量のDNAバリアントを並列クローニングした後、サンガーシーケンスによる予備的QCとNGSによるフルQCの実行。デフォルト納品物：大腸菌グリセロールストック。 | ￥356,500～ | 5～8週 |
| プール型ライブラリーのウイルスパッケージング | ウイルスパッケージングサービスの詳細は こちらをご覧ください。 ライブラリーのパッケージング価格は、通常パッケージング価格の1.5倍となります。 |
お問い合わせ | お問い合わせ |
| プール型ライブラリーサンプルのスクリーニング | ライブラリーのin vitroまたはin vivoスクリーニング。細胞生存率スクリーニング、薬剤耐性スクリーニング、パスウェイスクリーニング、レポータースクリーニング、表現型スクリーニング、ターゲットベーススクリーニング、毒性スクリーニング、およびその他のカスタムスクリーニング。 | お問い合わせ | プロジェクトに依存 |
| スクリーニングサンプルのNGSデコンボリューション | スクリーニングによって得られた細胞のゲノムDNAからのNGSライブラリーの作成、Illuminaシークエンス(500x以上のカバレッジ)およびデータ解析を含む。 | サンプル当たり￥65,000～ | 3～5週 |
| サービス項目 | 価格（税抜） | 納期 |
|---|---|---|
| カスタムライブラリー構築 | 上記をご確認ください | お問い合わせ |
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