受託オンライン
Commissioned Research Online

受託オンライン
株式会社薬研社

ID: J01598
ID: J01598
フナコシ / Synthego

CRISPRevolution sgRNA合成受託サービス

S. pyogenesに由来するCas9(SpCas9)用に最適化された「CRISPRevolution」と呼ばれるguideRNAの合成受託サービスです。


カテゴリ
遺伝子工学 > 遺伝子実験 > ゲノム編集(CRISPR-Cas9・TALEN・ZFN)
遺伝子工学 > カスタムオリゴヌクレオチド・プライマー・プローブ・遺伝子合成 > siRNA・RNAi・miRNA・shRNA合成

サービスについて

概要

S. pyogenesに由来するCas9(SpCas9)用に最適化された「CRISPRevolution」と呼ばれるguideRNAの合成受託サービスです。
標的配列(17~23 nt)をご指定いただくだけで、最大97%の高いゲノム編集効率を持つ一本鎖guideRNA(sgRNA)を合成し、キットとしてお届けいたします。

合成guideRNAを使用するメリット

  • Speed
    プラスミド由来guideRNAと比較して、Synthego社 CRISPRevolution Synthetic guide RNAはプラスミド配列デザイン・コンストラクト作製・シークェンス・プラスミドDNA精製が不要です。
    また、高価なin vitro transcription(IVT)キットを使用して貴重な実験時間を費やす必要がありません。
  • Accuracy
    Cas9タンパク質とのRNP複合体を導入することで、編集確率が格段に上昇します。
    トランスフェクションしゲノム編集が起こった後、Cas9と外因性RNAは分解します。これにより、オフターゲット効果の可能性は大きく減少します。
  • Throughput
    合成RNAは、従来のguideRNA作製技術では実現不可能だった拡張性をもたらします。
    guideRNAをプラスミドやin vitro transcription(IVT)法によって作製する際に伴うコストや労力といった負担を回避するために、数千ものguideRNAがあるライブラリーをオーダーできます。
  • Quality
    高品質な合成RNAは安定したCRISPRゲノム編集をもたらします。
    Synthego社はトランスフェクションやマイクロインジェクションに用いるRNAの品質と正確な量をコントロールすることにより、最も的確なゲノム編集効率を達成しました。
  • Price
    プラスミドまたはin vitro transcription(IVT)法によるguideRNA作製と比較して安価です。
  • Easy to Use
    Synthego社のサイト「CRISPR Knockout Guide Designer」より、120,000種以上のゲノムと9,000の生物種から選択することで、遺伝子ノックアウト用CRISPR guideRNAを簡単にデザインできます。
    製品はすぐにトランスフェクション可能な状態でお届けします。

特長

  • in vitro transcription(IVT)で作製されたsgRNAに比べ、編集効率が格段に良いsgRNAです。
  • SpCas9向けに最適化されています。
  • sgRNAを作製する際の面倒なアニーリング操作が不要です。
  • 100% DNAフリーです。
  • シングルオリゴヌクレオチドです。
  • 様々な細胞種に対応します。
  • 幹細胞および編集困難な細胞の編集用に、先頭3箇所の5’と3’末端RNA残基に2’-O-methyl analogsと3’phosphorothioate internucleotideを結合した化学修飾sgRNAもあります。

合成RNA(sgRNA)とプラスミドおよびIVTの比較

  Synthego(sgRNA) Plasmid in vitro Transcription (IVT)
guideRNA作製過程 1. 標的シークエンスを選択する。
2. 合成RNAを注文する。
1. 標的シークエンスを選択する。
2. DNAプライマーを準備する。
3. プラスミド内へguideRNAをPCRする。
4. 細胞内へトランスフェクトする。
5. 細胞をスクリーニングする。
6. シークエンスを検証する。
7. プラスミドDNAを精製する。
1. 標的シークエンスを選択する。
2. DNAプライマーを準備する。
3. PCRでguideRNAを作製する。
4. IVTを行う。
5. guideRNAを精製する。
製品購入後の
トランスフェクション
開始時間
納品後すぐ 1~2週間 1~3日
作業時間 数分 数日 1日
編集効率 最大90% 中~高 様々
品質 非常に高い 様々 低い(不純物があり、不一致もみられる)
初代細胞および幹細胞への効率 非常に良い 悪い 悪い
オフターゲット効果 非常に低い 様々(宿主ゲノム内へのDNA混入の可能性あり) 様々(IVT用酵素がエラーを引き起こす可能性あり)
高品質
Synthego社のCRISPRevolution guideRNAは高純度(単一ピーク)であるのに対し、IVTで作製したguideRNAは不純物が含まれる(複数のピークが見られる)。不純物はオフターゲットの原因となる。(fig.1

高効率と一貫性
3種類の異なるターゲット遺伝子に対して、CRISPRevolution guideRNAとIVTでゲノム編集を行った。どの遺伝子においても、IVTによって作製されたguideRNAに比べ、Synthego社guideRNAが高効率に安定した塩基の挿入/欠損(Indel formation)が確認できた。(fig.2

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
CRISPRevolution sgRNA合成受託サービス お問い合わせ お問い合わせ

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。