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株式会社薬研社

ID: J00524
ID: J00524
コスモ・バイオ / マクロジェン・ジャパン

マイクロアレイ受託解析サービス:CGH法による解析

Agilent社のCGHアレイを用いた解析サービスです。FFPE サンプルでの実績もあります。


カテゴリ
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 遺伝子発現解析・網羅遺伝子解析
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 変異解析(CGH / CNV Array解析)

サービスについて

概要

お客様のご用意されたリファレンスを用いてゲノム上のヌクレオチド構造のバリエーション(CNVやIndel等)を検証します。(ご希望により、マクロジェンでリファレンスDNAを提供可能です)。設計したプローブ密度により、推奨する製品が異なります。また、データ分析を通じて視覚的にわかりやすいゲノムとクロモゾームビューワーが提供されます。
カスタムのCGH解析もご要望に応じて提供可能です。

アレイの特徴

  Agilent
対応可能な種 Human、Mouse、Rat
使用するアレイ SurPrint 各種、G3、HDマイクロアレイ
特長
  • 高解像度(50~70mer)、高感度のCGH / CNVチップを使用します。
  • ヒト以外の種の CGH / CNV チップも対応可能です。(カスタム)
  • FFPE サンプルを用いたCGH解析の実績もあります。

解析内容

  • CGH分析(fig.1
    ・ADM-2 を用いた CNV セグメントレポート
    ・その他セグメントアルゴリズム(DNA copy(CBS)、HMM 等)
    ・GC波長の相関解析
    ・CNV領域の定義とサマリー
    ・CNV領域群集解析
    ・ゲノム多型データベース(DGV)によるマッピング

  • カスタム解析(fig.2
    ・プロッティングの追加、アノテーション等

ご送付いただくDNAサンプルのQC基準

プラット
フォーム
サンプル
タイプ
QC 条件 その他
純度(A260/280) 純度(A260/230) 濃度(ng/μL) 容量(μL) 総量(μg)
Agilent ゲノムDNA >1.5 >1.0 >70ng/μL >20μL >1.4μg 分解・増幅が
ないこと
Affymetrix
illumina

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

* 解析を含まないサービスのご注文の際は、品番末尾に「W」を入れて下さい(例: MAG-0012W)

プラットフォーム 最低注文
サンプル数
価格(税抜) 品番(*)
解析含む 解析含まない
Agilent CGH
Human
SurePrint G3 Human Genome CGH Microarray 1 x 1M
1
¥197,000
¥194,000
MAG-0012
SurePrint G3 Human Genome CGH Micorarray 2 x 400k
2
¥271,000
¥264,000
MAG-0013
SurePrint G3 Human Genome CGH Microarray 4 x 180k
4
¥361,000
¥349,000
MAG-0014
SurePrint G3 Human Genome CGH Microarray 8 x 60k
8
¥517,000
¥491,000
MAG-0015
SurePrint G3 CGH+SNP Microarray 2x400K
2
¥263,000
¥256,000
MAG-0106
SurePrint G3 ISCA CGH+SNP Microarray 4x180K
4
¥356,000
¥343,000
MAG-0107
SurePrint G3 ISCA CGH Microarray 8x60K
8
¥504,000
¥479,000
MAG-0108
illumina SNP/CGH
Human
Human Omni2.5-8 v1.1
32
¥1,754,000
¥1,651,000
MAG-0016
Human Omni2.5Exome-8 v1.1
16
¥903,000
¥851,000
MAG-0017
Human Omni5-Quad
16
¥1,394,000
¥1,343,000
MAG-0018
Human Omni5 Exome
16
¥1,423,000
¥1,371,000
MAG-0019
Human OmniZhongHua-8 v1.0
16
¥594,000
¥543,000
MAG-0020
Human OmniExpress-24 v1.0
48
¥1,471,000
¥1,317,000
MAG-0021
Human OmniExpressExome V1.2
16
¥569,000
¥517,000
MAG-0022
Human Exome v1.2
24
¥426,000
¥349,000
MAG-0023
HumanCore v1.0
24
¥426,000
¥349,000
MAG-0024
HumanCoreExome-24 v1.0
48
¥929,000
¥774,000
MAG-0025
Multi-Ethnic GWAS and Exome Array (MEGA)
16
¥491,000
¥440,000
MAG-0026
OncoArray-500K v1.0
48
¥1,086,000
¥929,000
MAG-0027
OmniZhongHua-8 v1.3
16
¥594,000
¥543,000
MAG-0109
Multi-Ethnic Global-8 v1.0
16
¥646,000
¥594,000
MAG-0110
Multi-Ethnic EUR/EAS/SAS-8 v1.0
16
¥594,000
¥543,000
MAG-0111
Multi-Ethnic AMR/AFR-8 v1.0
16
¥594,000
¥543,000
MAG-0112
Infinium QC Array-24 V1.0
48
¥466,000
¥310,000
MAG-0113
ImmunoArray-24 v2.0
48
¥776,000
¥620,000
MAG-0114
Infinium? Neuro Consortium Array
288
¥6,044,000
¥5,114,000
MAG-0115
Global Screening Array + Multi Diseases
24
¥700,000
¥543,000
MAG-0116
HumanPsychArray-24 v1.0
48
¥1,086,000
¥929,000
MAG-0028
Bovine
BovineSNP50 v2.0
48
¥1,394,000
¥1,240,000
MAG-0029
BovineLD v1.1
48
¥620,000
¥466,000
MAG-0030
Infinium? BovineLD v2.0
48
¥620,000
¥466,000
MAG-0117
BovineHD
16
¥774,000
¥723,000
MAG-0031
Canine
CanineHD
24
¥969,000
¥891,000
MAG-0032
Porcine
PorcineSNP60 v2
48
¥1,394,000
¥1,240,000
MAG-0033
Ovine
OvineSNP50
24
¥737,000
¥660,000
MAG-0034
Goat
GoatSNP50
48
¥1,860,000
¥1,706,000
MAG-0035
Maize
MaizeSNP50
48
¥1,394,000
¥1,240,000
MAG-0036
Potato
PotatoSNP80
24
¥543,000
¥466,000
MAG-0037
Soy bean
BARCSoySNP6k V2
192
¥1,860,000
¥1,240,000
MAG-0119
Tomato
TomatoSNP
24
¥580,000
¥503,000
MAG-0038
SolCAP Tomato array
48
¥1,009,000
¥853,000
MAG-0118
illumina CNV
Human
HumanCytoSNP-850K
8
¥633,000
¥607,000
MAG-0039
HumanCytoSNP-12 v2.1
12
¥600,000
¥561,000
MAG-0040
HumanCytoSNP FFPE-12 v2.1
12
¥600,000
¥561,000
MAG-0041
Affymetrix CNV
Human
OncoScan FFPE Assay Kit Array and Reagent Kit Bundle
24
¥5,589,000
¥5,486,000
MAG-0045

サンプルが Macrogen 社に到着しサンプル QC 完了後の標準納期は下記になります。

メーカー 標準納期
解析含む 解析含まない
Agilent 社 2.5週間 2週間
Affymetrix 社 2.5週間 2週間
illumina 社 2.5週間 2週間

*繁忙期にチップの在庫がない場合は上記よりも長く納期がかかります。


関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。