概要（fig.1）

• 16SrRNA遺伝子解析、およびメタゲノム遺伝子解析の解析受託サービスです。
• 新鮮サンプル（糞便、スワブなど）、またはDNAサンプルから、NGSを用いた遺伝子配列解析を受託いたします。
• マイメタゲノム社の豊富なノウハウと圧倒的な解析実績により最適化された、独自プロトコールおよび高精度解析パイプラインがご利用いただけます。

• 常在菌叢のサンプリングからデータ解析までの高速・高精度解析パイプライン
• 次世代シークエンサー（NGS）を用いた大量16S・メタゲノムデータ収集技術
• 常在菌叢の正常さや異常さを数値化して評価する高度な情報学・統計学手法
• 常在菌叢の全体構造の評価ならびに構成細菌の特定と存在量の定量解析
• 常在菌叢の高品質データベースの構築技術
• 個別微生物ゲノム解析技術

解析サービスの表示例

• NGSから得られる全16S・メタゲノム配列データ
  ：お客様の必要度によりご提供
• OTU解析表【各OTUの菌種（種レベル）帰属と16Sリード数】
  ：各菌種の存在割合等を表示
• OTU数、Chao1-OTU数、Shannon index等
  ：菌叢の多様性を評価（fig.2）
• 菌種組成比表（門・属・種レベル）
  ：マイメタゲノム社独自のデータベースによる菌種帰属と組成比（fig.3）
• 細菌叢間の全体構造の類似性評価
  ：UniFrac-PCoAや主成分分析等を用いて類似性を視覚的に表示
  ：類似性のANOVA等による統計評価
• 菌叢群間で有意に増減する菌種/OTUの特定
  ：複数群間で統計的有意に増減する菌種/OTUの単純OTU数比較あるいは機械学習Randomforest等による検索 （fig.4）
• 被験者個人の細菌叢（マイメタゲノム）の評価
  ：マイメタゲノム社独自の健常・疾患データベースをもちいた被験者細菌叢の視覚的な位置表示等（fig.5）

以上をまとめた総合的な解析データの解説まで
・健常群との相違の程度
・被験者に特徴的なデータ
・被験者の腸内細菌叢の総合的な評価…など

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注意事項

• 受託可能数：10検体以上から承ります。
• NGSはイルミナ社MiSeqを使用します。Ion PGM、IonProton、Sequelでの解析をご希望の場合はご相談ください。
• 受託可能な新鮮サンプルは、ヒトの糞便、唾液、皮膚、バイオプシ並びにマウス（動物）の糞便、バイオプシです。植物、および環境細菌叢の新鮮サンプルは受託できませんが、DNAからの環境細菌叢のサンプルの分析は受託可能です。