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株式会社薬研社

ID: J01527
ID: J01527
日本ジェネティクス / マイメタゲノム

菌叢解析受託サービス

新鮮サンプル(糞便、スワブなど)、またはDNAサンプルから、NGSを用いた遺伝子配列解析を受託いたします


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > 16S-rRNA アンプリコン解析(細菌叢解析)
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > メタゲノム解析・メタトランスクリプトーム解析

サービスについて

概要(fig.1

  • 16SrRNA遺伝子解析、およびメタゲノム遺伝子解析の解析受託サービスです。
  • 新鮮サンプル(糞便、スワブなど)、またはDNAサンプルから、NGSを用いた遺伝子配列解析を受託いたします。
  • マイメタゲノム社の豊富なノウハウと圧倒的な解析実績により最適化された、独自プロトコールおよび高精度解析パイプラインがご利用いただけます。
  • 常在菌叢のサンプリングからデータ解析までの高速・高精度解析パイプライン
  • 次世代シークエンサー(NGS)を用いた大量16S・メタゲノムデータ収集技術
  • 常在菌叢の正常さや異常さを数値化して評価する高度な情報学・統計学手法
  • 常在菌叢の全体構造の評価ならびに構成細菌の特定と存在量の定量解析
  • 常在菌叢の高品質データベースの構築技術
  • 個別微生物ゲノム解析技術

解析サービスの表示例

  • NGSから得られる全16S・メタゲノム配列データ
    :お客様の必要度によりご提供
  • OTU解析表【各OTUの菌種(種レベル)帰属と16Sリード数】
    :各菌種の存在割合等を表示
  • OTU数、Chao1-OTU数、Shannon index等
    :菌叢の多様性を評価(fig.2
  • 菌種組成比表(門・属・種レベル)
    :マイメタゲノム社独自のデータベースによる菌種帰属と組成比(fig.3
  • 細菌叢間の全体構造の類似性評価
    :UniFrac-PCoAや主成分分析等を用いて類似性を視覚的に表示
    :類似性のANOVA等による統計評価
  • 菌叢群間で有意に増減する菌種/OTUの特定
    :複数群間で統計的有意に増減する菌種/OTUの単純OTU数比較あるいは機械学習Randomforest等による検索 (fig.4
  • 被験者個人の細菌叢(マイメタゲノム)の評価
    :マイメタゲノム社独自の健常・疾患データベースをもちいた被験者細菌叢の視覚的な位置表示等(fig.5
以上をまとめた総合的な解析データの解説まで
・健常群との相違の程度
・被験者に特徴的なデータ
・被験者の腸内細菌叢の総合的な評価…など

注意事項

  • 受託可能数:10検体以上から承ります。
  • NGSはイルミナ社MiSeqを使用します。Ion PGM、IonProton、Sequelでの解析をご希望の場合はご相談ください。
  • 受託可能な新鮮サンプルは、ヒトの糞便、唾液、皮膚、バイオプシ並びにマウス(動物)の糞便、バイオプシです。植物、および環境細菌叢の新鮮サンプルは受託できませんが、DNAからの環境細菌叢のサンプルの分析は受託可能です。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス名 概要 単位 価格
(税抜)
納期
菌叢解析受託サービス
16SrRNA解析
DNA抽出+16s配列のデータ生産(3,000リード/サンプル)+データ解析 新鮮サンプル/1検体あたり ¥34,000 サンプル受付後2~3ヶ月
16s配列のデータ生産(3,000リード/サンプル)+データ解析 DNA/1検体あたり ¥29,000
DNA抽出+16s配列のデータ生産(3,000リード/サンプル) 新鮮サンプル/1検体あたり ¥30,000
16s配列のデータ生産(3,000リード/サンプル) DNA/1検体あたり ¥25,000
細菌叢16sデータ解析のみ 1検体あたり ¥26,000
メタゲノム解析サービス(1Gb)
DNA抽出+メタゲノム配列データ生産(~1Gb/サンプル)+データ解析 新鮮サンプル/1検体あたり ¥165,000 サンプル受付後2~3ヶ月
メタゲノム配列データ生産(~1Gb/サンプル)+データ解析 DNA/1検体あたり ¥135,000
DNA抽出+メタゲノム配列データ生産(~1Gb/サンプル) 新鮮サンプル/1検体あたり ¥145,000
メタゲノム配列データ生産(~1Gb/サンプル) DNA/1検体あたり ¥115,000
メタゲノム解析サービス(3Gb)
DNA抽出+メタゲノム配列データ生産(~3Gb/サンプル)+データ解析 新鮮サンプル/1検体あたり ¥250,000 サンプル受付後2~3ヶ月
メタゲノム配列データ生産(~3Gb/サンプル)+データ解析 DNA/1検体あたり ¥220,000
DNA抽出+メタゲノム配列データ生産(~3Gb/サンプル) 新鮮サンプル/1検体あたり ¥230,000
メタゲノム配列データ生産(~3Gb/サンプル) DNA/1検体あたり ¥200,000
DNA抽出サービス
試料からの微生物叢DNA抽出 新鮮サンプル/1検体あたり ¥13,000 サンプル受付後2~3ヶ月

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。