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株式会社薬研社

ID: J01571
ID: J01571
レリクサ / レリクサ

ATAC-seq受託解析サービス

シーケンスは低価格に、多様なバイオインフォマティクスニーズにもお応えします


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【エピゲノムシーケンス】 > ChIP-Seq解析(クロマチン免疫沈降サンプルの解析)
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代データマイニング

サービスについて

ATAC-seqとは

オープンクロマチン領域(ヌクレオソームのない領域)の分布を網羅的に解析する手法です。オープンクロマチン領域は、プロモーターやエンハンサーといった遺伝子発現制御領域に対応するもので、エピゲノムの骨格を調べる解析と言えます。

  • オープンクロマチン領域の網羅的解析に
  • 疾患や細胞変化に関連する重要な転写因子の探索に
  • RNA-seqとの統合解析に

特長

  • 丁寧なビフォア・アフターサポート
    15名以上のPh.D.が在籍しており、技術サポート体制に力を入れています。
  • 目的に応じたカスタムメイド解析
    基本解析からオーダーメイドの高次解析・統合解析まで幅広く対応します。
  • 追加費用ナシ
    データ転送費などの付帯費用はサービス価格に含まれています。

ChIP-seqとの違い

ATAC-seqはChIP-seqと異なり、調査したい抗体のない生物種でも実施することができます。また、ATAC-seqは免疫沈降が必要ない分、ChIP-seqよりも少ない細胞数で実施可能です。オープンクロマチン領域に見られる塩基配列を網羅的に解析することにより、注目するエピゲノム変化の原因となった転写因子などを予測することができます。


サービスプラン

  • 生データプラン
    シーケンスにより取得したfastqデータ(生データ)のみを納品するプランです。
  • ベーシック解析プラン
    基本解析を実施するプランです。種々の描画により、個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。
  • スタンダード解析プラン
    ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。
  • プレミアム解析プラン
    お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うコンサルティングサービスです。
    * プレミアムプランについてはプロジェクトの混雑状況によりお受けできない場合があります。ご了承ください。

解析例(fig.1)(fig.2)(fig.3

サービスの流れ

シーケンシングは原則として国内外のレリクサ社提携先(Illumina社のService Provider認証取得済み)での実施となります。バイオインフォマティクス解析は全てレリクサ社で実施し、納品いたします。


データ取得からご依頼時の流れ



  • データ取得からご依頼いただいた場合、提携先にて⑤サンプルのクオリティチェック(QC)を必ず実施し、QC結果をお客様にご報告いたします。クオリティに問題があった場合は、サンプルの再提出・シーケンスの実施・一部キャンセルの中からお客様にご判断いただきます。
  • シーケンスのキャンセルは無償ですが、送付いただいた全てのサンプルがキャンセルとなり、かつサンプルの再提出もない場合は、海外輸送実費をご負担いただきますので、あらかじめご了承ください。尚、QC料金は全てサービス価格に含まれております。
データ解析のみご依頼時の流れ



  • お客様自身または他社サービスで解析済みのデータから追加解析をご依頼いただいた場合、どのような情報処理プログラムを用いて解析を実施されたか確認する必要があるため、原則としてデータの事前調査費用が発生いたします。
  • 生データからデータ解析のみをご依頼いただいた場合、上記費用は発生いたしません。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
ATAC-seq お問い合わせ サンプル受領から6~8週

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。