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株式会社薬研社

ID: J01484
ID: J01484
生物技研 / 生物技研

パスウェイ解析

KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)を利用したパスウェイ解析です


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【RNAシーケンス】 > RNA-Seq解析・TruSeq(微量)トランスクリプトーム解析
遺伝子工学 > バイオインフォマティクス > バイオインフォマティクス

サービスについて

概要

KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)を利用したパスウェイ解析です。 RNAseq解析から明らかになった発現変動遺伝子やゲノム解析から同定された遺伝子が、どのような代謝系に関わっているのかを可視化させます。

パスウェイ解析参考例

KEGG Mapperに納品データのKEGG IDをインポートすると以下のように可視化できます。

異なる温度で培養したバクテリアのRNAseq解析の結果を可視化した事例
赤あるいは緑で塗られた部分が、各培養条件で有意に発現上昇された遺伝子を示します。

・酸化的リン酸化(fig.1
・ピルビン酸代謝(fig.2

納品データ

テキストデータで納品します。エクセルで開くことができます。(fig.3

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参考価格・納期

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