KOTAI バイオテクノロジーズ / KOTAI バイオテクノロジーズ ID: J01547

シングルセル免疫プロファイリング ID: J01547

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1細胞単位のTCR / BCR発現を調べることができ、TCR α鎖 / β鎖あるいはBCR H鎖 / L鎖のペアを検出することができます。

カテゴリ

サービスについて

概要

シングルセル免疫プロファイリングでは個々のT細胞 / B細胞のmRNAにそれぞれ異なるバーコードを付けることで、1細胞単位のTCR / BCR 発現を調べることができます（TCR/BCRはヒトまたはマウスが対象です）。
標準的なレパトア解析ではサンプル中のTCR / BCR発現を包括的に解析しますが、シングルセル免疫プロファイリングでは、細胞ごとにヘテロ2量体であるTCR / BCRレパトアを解析することができます。
なお、シングルセル免疫プロファイリングに加え、シングルセル遺伝子発現解析（Single Cell 5’RNA-Seq）も実施可能です。（fig.1）（fig.2）

fig.1 シングルセルの液滴内への閉じ込め

fig.2 1細胞のTCR/BCRライブラリ作成

特徴

希少なTCR / BCR発現を検出
細胞ごとのTCR / BCRが同定可能
BCR（Ig）のH鎖 / L鎖または、TCRのα鎖 / β鎖配列のペア解析が可能。TCR / BCR解析と併せてSingle Cell 5’RNA-seqも実施可能

解析例（fig.3）（fig.4）

fig.3 Cellrangerによる解析結果をLoupe Browser 8.0で開いたところ

fig.4 Cellrangerによる解析結果をLoupe Browser 8.0で開いたところ

解析可能なサンプル

サンプル	凍結細胞（凍結していない生細胞についても出張にて対応が可能です）
動物種	ヒトまたはマウス（TCR/BCR）全生物種（TCR/BCR以外）
解析メカニズム	Template Switch Oligoを用いた逆転写で5’末端側からキャプチャーしライブラリを作製します。
サンプル受け入れ条件	詳細情報ページ参照

納品物

KOTAIバイオテクノロジーズ社がシーケンスを行う場合	Fastqデータ Cell Ranger解析結果 - Web Summary - cloupeファイル - Matrixファイル - csvなど情報シート（解析方法や使用試薬などをまとめたもの）実験情報まとめ（細胞数や生存率cDNAやライブラリの測定結果）
お客様がシーケンスをされる場合	ライブラリー情報シート実験情報まとめ

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

受託内容	価格（税抜）	納期
Chromium GEM-X Single Cell 5’RNA+BCR-seq （実験+シーケンス+解析）	￥1,113,000	6週間
Chromium GEM-X Single Cell 5’RNA+TCR-seq （実験+シーケンス+解析）	￥1,113,000	6週間

＊細胞種や解析内容によっては、上下することもございます。
＊組み合わせ方を自由に、必要な工程だけをご依頼いただくことも可能です。
　「サンプル調製からライブラリ作製まで」「cDNA合成後から」「シーケンスのみ」など、工程の一部のみの受託も承っております。

オプション	価格（税抜）
出張による新鮮細胞からの実験対応オプション細胞数が少ない場合や凍結すると生存率が低くなる場合、機器を貴研究室に持ち込み、新鮮細胞からシングルセル化を行います。	お問い合わせ（要交通費実費）
サンプル混合オプション（hasgtag抗体）複数サンプルを混ぜて解析することが可能です。1サンプルあたりの細胞数は減りますが解析コストを抑えることが可能です。	お問い合わせ
CITE-seqオプション（表面タンパク質検出）シングルセルレベルで細胞表面タンパク質の検出を行うことができます。	お問い合わせ
死細胞除去オプション生存率が低いサンプルに対し、FACSによる死細胞除去を実施します。	￥50,000

＊オプションに関する詳細は、詳細情報ページをご確認ください。

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