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ユーロフィンジェノミクス / ユーロフィンジェノミクス

次世代シーケンス エクソーム解析

シーケンス解析のターゲットをエキソンに絞り込むことにより、目的の遺伝子パネルに対して豊富なシーケンスデータを得ることができます。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > エクソーム解析

サービスについて

特長(fig.1

シーケンス解析のターゲットをエキソンに絞り込むことにより、目的の遺伝子パネルに対して豊富なシーケンスデータを得ることができます。エキソン領域の濃縮には、Agilent SureSelectシリーズ (*)を用います。
* Human All Exon V6 Kitなど最新のシリーズに対応しています。

サービス内容

  1. 受領したRNAサンプルについて、品質確認(サンプルQC)を行います。
  2. DNAを断片化します。
  3. 断片化したDNAにアダプターを付加します。
  4. Agilent SureSelectシリーズを用いてエキソン濃縮を行います(*)。
  5. 調製したライブラリーをシーケンシングします。
  6. (オプション解析)参照ゲノムにマッピングした後、変異箇所の抽出などの解析が可能です。
* ご希望のキットがございます場合はご相談ください。
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サンプル条件

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

  • 高品質のゲノムDNAを5μg以上(濃度は25ng/μL以上)ご調製ください。
  • 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
  • DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
  • 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
  • RNAのコンタミネーションがないことを確認してください(RNase処理を推奨)。
  • 冷蔵もしくは冷凍便にてユーロフィンジェノミクスへ送付してください。
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納品物

エクソームシーケンシングデータのマッピング&変異解析

解析なしの場合
  • シーケンシング配列データ(Rawデータ):FASTQ形式

解析ありの場合
  • シーケンシング配列データ(クリーニング後):FASTQ形式
  • マッピング結果データ bam形式
  • 変異解析結果データ: vcf形式
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ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


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参考価格・納期

サービス項目 価格 納期
エクソーム解析
Hiseq2500/2000 2×100bp (*1)4Gb/total~
¥170,000/sample (*2) 8~12週間

*1 2x125bpの場合の価格・納期についてはご相談ください。
*2 4サンプル以上から承ります。条件につきましては、お問合せください。
* その他のサンプルQC、ライブラリ調製、出荷費用を含みます。

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関連サイト

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※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。