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株式会社薬研社

ID: J01783
ID: J01783
ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ / ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ

miRNA解析

MiRXES社のID3EALテクノロジーが拓く最先端のmiRNA解析


カテゴリ
遺伝子発現解析 > リアルタイムPCR関連解析 > miRNA解析・mRNA解析・Taqman Array解析・microRNA解析

サービスについて

概要

HMTではシンガポールに拠点を置くMiRXES社と提携し、miRNA(microRNA)解析サービスをご提供しています。
MiRXES社のmiRNA特異的プライマー設計技術「ID3EALTMテクノロジー」を利用したmiRNA解析の受託サービスのほか、がんや体液を対象としたパネル(キット)製品の販売プライマーの販売も行っております。
HMTではMiRXES社と提携し、お客様のニーズに合わせた2種類のmiRNA受託解析サービスをご提供しています。
測定希望の試料をお送りいただくだけで、MiRXES社にて抽出から測定まで行いデータを納品いたします。

MiRXESのID3EALTMテクノロジー

1塩基レベルの違いも識別できる極めて高い特異性
ID3EALTMテクノロジーは、miRNA定量において重要となる、相同性の高いmiRNA間の識別において極めて高い精度を実現しています。
fig.1)のlet-7 miRNAファミリーを用いた特異性の検討例では、各アイソフォームは1塩基程度の差しかない高い相同性を有するにもかかわらず、明確に識別することができました。
既存製品では数%~数十%検出され、時には全く区別のできないこともあるアイソフォームであっても、ID3EALTMテクノロジーであれば明確に区別することが可能です。

高い増幅効率と検出感度
ID3EALTMテクノロジーでは既存製品と比較して、高い増幅効率を実現し微量なmiRNAを検出することが可能です。 また通常は増幅が難しいとされるAT含有率の高いmiRNAであっても、既存製品に比べてばらつきが抑えられ、安定して検出できます。(fig.2
AT含有率の高いmiRNAは検出が困難な場合もありますが、ID3EALTMテクノロジーによって高い感度で検出することができます。
miRNAプロファイリングの高い再現性
ID3EALTMテクノロジーではmiRNAプロファイリングの高い再現性を得ることが可能です。
2つの異なる研究室において、異なるRNA精製法と異なる測定機器を用いて1年以上にわたって測定した結果について同等性試験を行ったところ、30のがん患者血清から得られた200以上のmiRNAに関し、相関係数は0.92~0.96であり、非常に高い再現性が得られました。(fig.3

3つのプライマーを各miRNA特異的にデザイン(特許技術)
RT-qPCR法によるmiRNAの検出は、逆転写によるcDNAの合成とその後のqPCRによる検出の2段階の反応を経て行われます。これらの反応のうち、逆転写には逆転写用のRTプライマー1種類、qPCR検出にはForwardとReverseの2種類のプライマーが必要となります。
これら合計3つのプライマーのうち、既存手法では1つまたは2つのユニバーサルプライマー(すべての標的miRNAに共通のプライマー)が使われています。
一方でMiRXES社のID3EALTMテクノロジーでは、ステムループ構造も特異的な設計を施した、成熟型miRNAのみに特異的なRTプライマーを用いており、qPCR用のプライマー2つも標的miRNA特異的に設計することで、既存手法よりも優れた検出特異性と検出感度を実現しています。(fig.4
また、MiRXES社の製品は主要メーカーのほとんどのqPCR装置に対応しており、幅広いニーズに応えることが可能です。

PanoramiR miRNA KNOWLEDGE PANEL

バイオマーカー探索や疾患のメカニズム解析に最適な376種類のmiRNAを標的とするパネルを用いた受託解析サービス
様々な疾患に関連する厳選されたmiRNA 376種類のプロファイリングパネルを用いた受託解析サービスです。
標的miRNAは、miRbase 22、HMDD v3.2、The Cancer Genome Atlasといったデータベースや自社研究および影響度の高い学術論文データをもとに厳選しています。
バイオマーカー探索や疾患メカニズム解析の基礎研究などにおすすめです。

Premium 700

700種類のmiRNAに対して絶対定量を行う受託解析サービス
ID3EALTMテクノロジーを用いて、700種類のmiRNAに対して絶対定量を行う受託解析サービスです。
臨床試験、バイオマーカー探索などにおすすめです。

ID3EALTM 受託解析サービスの比較

解析プラン名 PanoramiR Premium 700
測定対象miRNA 376種 700種
対象試料種 ヒト
定量 相対定量 絶対定量
データ解析 Raw Data Cleaning、Normalization、Fold-change and p-values、Clustering、
Principal Component Analysis、Volcano Plots(最大3比較まで可)
最少検体数 6検体~ 40検体~
納期 <60検体:約8週間
<120検体:約8~12週間
<60検体:約8~12週間
<120検体:約12~16週間

* 本サービスは研究の目的にのみ使用されるものです。


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