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株式会社薬研社

ID: J00534
ID: J00534
コスモ・バイオ / Cellecta

CRISPR ヒト/マウスゲノムワイド sgRNA ライブラリ

低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現!!


カテゴリ
遺伝子工学 > 遺伝子実験 > ゲノム編集(CRISPR-Cas9・TALEN・ZFN)

サービスについて

サービス概要

Cellecta社のゲノムワイドなヒト/マウスプール型レンチウイルスsgRNAライブラリは標的遺伝子分野が異なる3つのModuleから構成されており、機能欠損スクリーニングにご利用いただけます。各Moduleには約6,500種類の遺伝子を標的とする約55,000種類のsgRNAが含まれています。またゲノムワイドなSingle Moduleもご用意しており、約19,000種類の遺伝子を標的とする約80,000種類のsgRNAが含まれています。各Moduleには1標的遺伝子に対して最大8種類のsgRNAが設計されています。本ライブラリはsgRNAごとに異なるバーコード配列が発現カセットに挿入されているため、スクリーニング後に次世代シーケンス解析することでノックアウトされた標的遺伝子を特定可能です。
スクリーニング実験後の細胞をご送付いただき、次世代シーケンスを行う受託サービスもご用意しております。

プール型レンチウイルス sgRNAライブラリ実験概要(fig.1

シングルモジュールのライブラリも販売開始!
1つのライブラリで19,000protein-coding geneをカバーしており、各遺伝子について4つのsgRNAデザイン、約80,000sgRNAがプールされております。

sgRNAライブラリの特徴

  • 各標的遺伝子に対して4~8種類のsgRNA
  • 全てのライブラリを合わせるとほぼ全ての遺伝子をカバー(19,000以上)
  • Illumina HiSeqおよびGAIIx、NextSeqにより標的遺伝子を特定可能
CRISPR Human Genome Knockout Library 標的分野標的遺伝子数sgRNA数
Module 1 シグナル伝達 6,555 約55,000
Module 2 疾患関連
既知薬剤ターゲット
6,262 約55,000
Module 3 細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA結合
6,184 約55,000
Single-module(80K) ゲノムワイド 約19,000 約80,000

詳細(fig.2

各sgRNAライブラリの標的遺伝子リストやマニュアル等は下記のリンクからダウンロードして下さい。

納品形態 sgRNA Library 標的遺伝子リスト Product Analysis Certificate User Manual
プラスミドライブラリ Module 1 Excel PDF PDF
Module 2 Excel PDF
Module 3 Excel PDF
Single Module (80K) Excel PDF
パッケージ済みウイルスフォーム Module 1 Excel PDF
Module 2 Excel PDF
Module 3 Excel PDF
Single Module (80K) Excel PDF

本ライブラリは U6プロモーターでsgRNAを発現し、ヒトユビキチンCプロモーター下に TagRFP(Evrogen)とピューロマイシン耐性遺伝子を配置した下記ベクターを使用しております。

CRISPR Library Vector NGS Cassette Sequence(.txt | .dna(*))
pRSG16-U6-sg-HTS6C-UbiC-TagRFP-2A-Puro HTS6C-noBCPDF FASTA | SnapGene

* dnaフォーマットファイルを開くために SnapGene® Viewerをダウンロードして下さい。

本ライブラリは広く使用されている第二、または第三世代のVSV-G偽型ウイルス粒子や、Cellecta社の第二世代のpsPAX2/pMD2.G packaging plasmid mix(Ready-to-use Packaging Plasmid Mix, 品番:CPCP-K2A, 250μg)によりパッケージすることができます。Cellecta社のパッケージ済みライブラリのタイターは293T細胞にトランスダクションし、RFP陽性細胞のFACSにより決定可能です。

sgRNAライブラリスクリーニングの次世代シーケンス解析受託サービス

本サービスは、CLT社ライブラリを使用して調製した各サンプルの凍結ペレット(細胞・組織)をご提供いただき、CLT社にてDNA抽出・増幅、次世代シークエンシングデータ取得・解析を行い、sgRNA配列のリストをご提供するものです。サンプルは、フェノール-クロロホルム耐性の15mLサイズのポリプロピレン遠心用チューブに保管し、黒色または青色のアルコール耐性マーカーで各チューブにサンプル名をご記入いただき、チューブラベルとサンプル詳細とを記載したリストと共にCLT社へドライアイス便でご発送ください。

1. お申込書類記載
2. CLT社へ細胞・組織ペレット(品番 CANA-SQ)、またはゲノムDNA(品番 CANA-SQD)の送付
3. CLT社にて実験・解析作業
  1. 各サンプルからゲノムDNAを抽出する(細胞、組織ペレットの場合)
  2. 抽出したゲノムDNA のバーコードを増幅後、ハイスループットシークエンシング調製する
  3. 各サンプルの増幅されたバーコードをシークエンス(>20x106リード)
  4. 各バーコードをsgRNA配列と照合させ、解析する
    (ア)各sgRNA配列の相対存在量の算出(バーコード/sgRNA数)
    (イ)サンプル間の差異計算(お客様より何れのサンプル間を比較するという情報をいただいた場合に限ります)
  5. 報告書を作成
4. コスモ・バイオより報告書(電子データ)を納品

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

  • プラスミドライブラリ
品番 品名 標的分野 包装 価格(税抜) 納期
KOHGW-M1-P CRISPR Human Genome Knockout Library,
Module 1
シグナル伝達 200μg お問い合わせ 約3週間
KOHGW-M2-P CRISPR Human Genome Knockout Library,
Module 2
疾患関連
既知薬剤ターゲット
KOHGW-M3-P CRISPR Human Genome Knockout Library,
Module 3
細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA 結合遺伝子
KOHGW-80K-P CRISPR Human Genome 80K Knockout Library,
Single Module
ゲノムワイド
KOMGW-80K-P CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (plasmid) ゲノムワイド

営利団体のお客様と非営利団体のお客様で品番と価格が異なります。詳細はお問合せください。

  • パッケージ済みウイルスフォーム
品番 品名 標的分野 包装 価格(税抜) 納期
KOHGW-M1-V8 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 1 シグナル伝達 2 x 108TU お問い合わせ 約5週間
KOHGW-M2-V8 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 2 疾患関連
既知薬剤ターゲット
KOHGW-M3-V8 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module3 細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA 結合遺伝子
KOHGW-80K-V9 CRISPR Human Genome 80K Knockout Library, Single Module ゲノムワイド
KOMGW-80K-V8 CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (virus) ゲノムワイド
KOHGW-M1-V9 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 1 シグナル伝達 1 x 109TU
KOHGW-M2-V9 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 2 疾患関連
既知薬剤ターゲット
KOHGW-M3-V9 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 3 細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA 結合遺伝子
KOHGW-80K-V9 CRISPR Human Genome 80K Knockout Library, Single Module ゲノムワイド
KOMGW-80K-V9 CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (virus) ゲノムワイド

営利団体のお客様と非営利団体のお客様で品番と価格が異なります。詳細はお問合せください。

  • Cas9発現用ベクター及びパッケージング済ウイルス粒子
品番 品名 包装 価格(税抜)
SVC9-PS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Hygro (plasmid) 25μg ¥68,000
SVC9B-PS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Blast (plasmid) 25μg ¥68,000
SVC9-VS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Hygro (packaged virus) 1 x 106TU ¥116,000
SVC9B-VS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Blast (packaged virus) 1 x 106TU ¥116,000

  • パッケージング用製品
品名 メーカー 品番 包装 価格(税抜)
293LTV Cell Line, CBL LTV-100 1VIAL ¥81,000
Ready-to-Use Packaging Plasmid Mix (250ug), CLT CPCP-K2A 1EACH ¥68,000

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。