ID: J00534
ID: J00534
コスモ・バイオ / Cellecta
CRISPR ヒト/マウスゲノムワイド sgRNA ライブラリ
低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現!!
カテゴリ
遺伝子工学 > 遺伝子実験 > ゲノム編集(CRISPR-Cas9・TALEN・ZFN)
サービスについて
サービス概要
Cellecta社のゲノムワイドなヒト/マウスプール型レンチウイルスsgRNAライブラリは標的遺伝子分野が異なる3つのModuleから構成されており、機能欠損スクリーニングにご利用いただけます。各Moduleには約6,500種類の遺伝子を標的とする約55,000種類のsgRNAが含まれています。またゲノムワイドなSingle Moduleもご用意しており、約19,000種類の遺伝子を標的とする約80,000種類のsgRNAが含まれています。各Moduleには1標的遺伝子に対して最大8種類のsgRNAが設計されています。本ライブラリはsgRNAごとに異なるバーコード配列が発現カセットに挿入されているため、スクリーニング後に次世代シーケンス解析することでノックアウトされた標的遺伝子を特定可能です。スクリーニング実験後の細胞をご送付いただき、次世代シーケンスを行う受託サービスもご用意しております。
プール型レンチウイルス sgRNAライブラリ実験概要(fig.1)
シングルモジュールのライブラリも販売開始! 1つのライブラリで19,000protein-coding geneをカバーしており、各遺伝子について4つのsgRNAデザイン、約80,000sgRNAがプールされております。 |
sgRNAライブラリの特徴
- 各標的遺伝子に対して4~8種類のsgRNA
- 全てのライブラリを合わせるとほぼ全ての遺伝子をカバー(19,000以上)
- Illumina HiSeqおよびGAIIx、NextSeqにより標的遺伝子を特定可能
CRISPR Human Genome Knockout Library | 標的分野 | 標的遺伝子数 | sgRNA数 |
---|---|---|---|
Module 1 | シグナル伝達 | 6,555 | 約55,000 |
Module 2 | 疾患関連 既知薬剤ターゲット |
6,262 | 約55,000 |
Module 3 | 細胞表面マーカー 細胞外マトリックス DNA結合 |
6,184 | 約55,000 |
Single-module(80K) | ゲノムワイド | 約19,000 | 約80,000 |
詳細(fig.2)
各sgRNAライブラリの標的遺伝子リストやマニュアル等は下記のリンクからダウンロードして下さい。納品形態 | sgRNA Library | 標的遺伝子リスト | Product Analysis Certificate | User Manual |
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プラスミドライブラリ | Module 1 | ![]() |
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Module 2 | ![]() |
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Module 3 | ![]() |
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Single Module (80K) | ![]() |
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パッケージ済みウイルスフォーム | Module 1 | ![]() |
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Module 2 | ![]() |
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Module 3 | ![]() |
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Single Module (80K) | ![]() |
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本ライブラリは U6プロモーターでsgRNAを発現し、ヒトユビキチンCプロモーター下に TagRFP(Evrogen)とピューロマイシン耐性遺伝子を配置した下記ベクターを使用しております。
CRISPR Library Vector | NGS Cassette | Sequence(.txt | .dna(*)) |
---|---|---|
pRSG16-U6-sg-HTS6C-UbiC-TagRFP-2A-Puro | HTS6C-noBC![]() |
FASTA | SnapGene |
* dnaフォーマットファイルを開くために SnapGene® Viewerをダウンロードして下さい。
本ライブラリは広く使用されている第二、または第三世代のVSV-G偽型ウイルス粒子や、Cellecta社の第二世代のpsPAX2/pMD2.G packaging plasmid mix(Ready-to-use Packaging Plasmid Mix, 品番:CPCP-K2A, 250μg)によりパッケージすることができます。Cellecta社のパッケージ済みライブラリのタイターは293T細胞にトランスダクションし、RFP陽性細胞のFACSにより決定可能です。
sgRNAライブラリスクリーニングの次世代シーケンス解析受託サービス
本サービスは、CLT社ライブラリを使用して調製した各サンプルの凍結ペレット(細胞・組織)をご提供いただき、CLT社にてDNA抽出・増幅、次世代シークエンシングデータ取得・解析を行い、sgRNA配列のリストをご提供するものです。サンプルは、フェノール-クロロホルム耐性の15mLサイズのポリプロピレン遠心用チューブに保管し、黒色または青色のアルコール耐性マーカーで各チューブにサンプル名をご記入いただき、チューブラベルとサンプル詳細とを記載したリストと共にCLT社へドライアイス便でご発送ください。1. | お申込書類記載 |
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2. | CLT社へ細胞・組織ペレット(品番 CANA-SQ)、またはゲノムDNA(品番 CANA-SQD)の送付 |
3. | CLT社にて実験・解析作業 |
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4. | コスモ・バイオより報告書(電子データ)を納品 |
ご注文に関して
お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。
参考価格・納期
品番 | 品名 | 標的分野 | 包装 | 価格(税抜) | 納期 |
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KOHGW-M1-P | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 1 |
シグナル伝達 | 200μg | お問い合わせ | 約3週間 |
KOHGW-M2-P | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 2 |
疾患関連 既知薬剤ターゲット |
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KOHGW-M3-P | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 3 |
細胞表面マーカー 細胞外マトリックス DNA 結合遺伝子 |
|||
KOHGW-80K-P | CRISPR Human Genome 80K Knockout Library, Single Module |
ゲノムワイド | |||
KOMGW-80K-P | CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (plasmid) | ゲノムワイド |
営利団体のお客様と非営利団体のお客様で品番と価格が異なります。詳細はお問合せください。
品番 | 品名 | 標的分野 | 包装 | 価格(税抜) | 納期 |
---|---|---|---|---|---|
KOHGW-M1-V8 | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 1 | シグナル伝達 | 2 x 108TU | お問い合わせ | 約5週間 |
KOHGW-M2-V8 | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 2 | 疾患関連 既知薬剤ターゲット |
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KOHGW-M3-V8 | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module3 | 細胞表面マーカー 細胞外マトリックス DNA 結合遺伝子 |
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KOHGW-80K-V9 | CRISPR Human Genome 80K Knockout Library, Single Module | ゲノムワイド | |||
KOMGW-80K-V8 | CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (virus) | ゲノムワイド | |||
KOHGW-M1-V9 | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 1 | シグナル伝達 | 1 x 109TU | ||
KOHGW-M2-V9 | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 2 | 疾患関連 既知薬剤ターゲット |
|||
KOHGW-M3-V9 | CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 3 | 細胞表面マーカー 細胞外マトリックス DNA 結合遺伝子 |
|||
KOHGW-80K-V9 | CRISPR Human Genome 80K Knockout Library, Single Module | ゲノムワイド | |||
KOMGW-80K-V9 | CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (virus) | ゲノムワイド |
営利団体のお客様と非営利団体のお客様で品番と価格が異なります。詳細はお問合せください。
品番 | 品名 | 包装 | 価格(税抜) |
---|---|---|---|
SVC9-PS | CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Hygro (plasmid) | 25μg | ¥68,000 |
SVC9B-PS | CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Blast (plasmid) | 25μg | ¥68,000 |
SVC9-VS | CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Hygro (packaged virus) | 1 x 106TU | ¥116,000 |
SVC9B-VS | CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Blast (packaged virus) | 1 x 106TU | ¥116,000 |
品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 価格(税抜) |
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293LTV Cell Line, | CBL | LTV-100 | 1VIAL | ¥81,000 |
Ready-to-Use Packaging Plasmid Mix (250ug), | CLT | CPCP-K2A | 1EACH | ¥68,000 |
関連サイト
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ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。 - ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
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