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株式会社薬研社

ID: J01668
ID: J01668
日本ジェネティクス / 日本ジェネティクス

rRNA除去&ストランド特異的 RNA-Seq

Ribo-Zero にて、rRNAを除去した後、ストランド特異的ライブラリーを調製してシーケンスを行います。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【RNAシーケンス】 > miRNA-Seq(miRNAシーケンス解析・small RNA発現解析)
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【RNAシーケンス】 > RNA-Seq解析・TruSeq(微量)トランスクリプトーム解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析

サービスについて

サービス仕様

  • シーケンシング:NovaSeq 6000 / PE150
  • 納品データ:fastqファイル形式
    * Read1とRead2それぞれ作成されますので、1サンプルにつき2つのファイルを納品いたします。
  • 使用できるライブラリ調製キット
    ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Gold (ヒト・マウス・ラット)
    ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Plant (植物由来サンプル)
    ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Plus (ヒト、マウス、ラット、細菌、疫学サンプル)
    ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Globin (血液サンプル)
    ・TruSeq stranded Total RNA Kit, NEBnext rRNA depletion Kit(Bacteria) (細菌サンプル)
  • 取得合計データ量が100 G base 未満の場合は、基本はクラウド納品となります。
    取得合計データ量が110 G base 以上になった場合は、HDDでの納品となります。

対応できる解析メニュー

  • Expresion Profile
  • Expresion Profile、DEG
  • Pathway解析(KEGG Enrichiment Analysis)
  • Fusion Gene Prediction Results
  • RNA-Seq De novo Assemble+Annotation
  • De novo RNA-Seq Expresion Profile、DEG
* 比較解析パターン数によっては、追加費用が発生する場合があります。
* サンプルの⽣物種によっては対応できない場合もあります。

サンプル要件

  • RNA量:0.5µg以上(total RNA)
  • RIN値:7以上
  • rRNA比:1以上
* Sample QC(Quality Check)の際に、Sampleを2~3µL使用します。
  Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
rRNA除去&ストランド特異的 RNA-Seq お問い合わせ サンプルQC合格後6週前後

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。