次世代シーケンス GRAS-Di^® 技術によるゲノム解析

概要

ゲノムワイドなジェノタイピング
コスト良く迅速に、マーカー探索、マーカー選抜、QTL解析、連鎖地図作成等をサポートいたします。

GRAS-Di^® 技術はトヨタ自動車株式会社にて開発されました。

2回のPCR反応によりゲノムを一様にカバーしたアンプリコンを増幅後、次世代シーケンサーにてシーケンスを行い、独自に開発されたソフトでジェノタイピング解析を行います。

GRAS-Di^® はトヨタ自動車株式会社の登録商標です。
GRAS-Di（グラス ディーアイ） Genotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct

特長

• GBSやRAD-seqに比べて解析領域の偏りが少なく、ゲノム上一様なジェノタイピングが可能。
• アンプリコン増幅の再現性が非常に高く、ジェノタイプデータの欠損が少ない。
• ゲノム情報が利用可能な生物種では、アンプリコンマーカーのマッピングとSNP抽出も可能。
• リファレンス配列が未決定の生物種においても、比較解析を行うサンプルがお手元にあれば、ゲノムワイドなジェノタイピング解析が可能。

サービス内容

ライブラリ調製からシーケンスデータ解析まで

　1. GRAS-Di^® ライブラリ調製
　　2回のPCR反応によりゲノムを一様にカバーしたアンプリコンを増幅
　2. HiSeq2500によるシーケンス
　3. GRAS-Di^® 解析ソフトによるシーケンスデータの解析
　　アンプリコンの有無をベースにしたジェノタイピング結果

オプション：ゲノム情報が利用可能な生物種では、バイオインフォマティクスのご相談を承ります。
（アンプリコンマーカーのマッピングやSNP抽出）
＊ 解析可能な生物種についてはお問い合わせください。

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納品物

シーケンシング配列データ FastQ形式、GRAS-Di^® 解析ソフトによる解析結果（Excelで閲覧可能な形式） ページ先頭へ戻る

サンプルについて

• gDNA：>30ng/μL、>20μLをお送りください。（規定量に満たない場合はご相談ください）
• 濃度はUVを用いた吸光光度法により測定・ご確認ください。（蛍光測定法による定量はご遠慮ください）
• 冷蔵便もしくは冷凍便にてサンプルをユーロフィンへご送付ください。
• TEへ溶出したgDNAサンプルをご準備ください。

＊ サンプルが規定量に達しない場合はご相談ください。
＊ 電気泳動法などを利用し、RNAのコンタミネーションがないこと、gDNAが分解していないことをご確認ください。