特長

• GBSやRAD-seqに比べて解析領域の偏りが少なく、ゲノム上一様なジェノタイピングが可能。
• アンプリコン増幅の再現性が非常に高く、ジェノタイプデータの欠損が少ない。
• ゲノム情報が利用可能な生物種では、アンプリコンマーカーのマッピングとSNP抽出も可能。
• リファレンス配列が無い生物種においてもジェノタイピングが可能。
• リファレンス配列が未決定の生物種においても、比較解析を行うサンプルがお手元にあれば、ゲノムワイドなジェノタイピング解析が可能。
• 分離集団また自然集団においてもジェノタイピングが可能。

GRAS-Di^®技術はトヨタ自動車株式会社にて開発されました。
GRAS-Di^®はトヨタ自動車株式会社の登録商標です。
GRAS-Di（グラス ディーアイ） Genotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct

サービス内容

ランダムプライマーセットを用いた2回のPCR反応により、ゲノムを一様にカバーしたアンプリコンを増幅後、次世代シーケンサーにてシーケンスを行い、独自に開発された ソフトでジェノタイピング解析を行います。

ライブラリ調製からシーケンスデータ解析まで

　1. GRAS-Di^® ライブラリ調製
　2. NovaSeq6000によるシーケンス
　3. GRAS-Di^® 解析ソフトによるシーケンスデータの解析
　　（アンプリコンの有無をベースにしたジェノタイピング結果、アンプリコンマーカーのマッピング結果）

オプション：ゲノム情報が利用可能な生物種では、バイオインフォマティクスのご相談を承ります。（SNP抽出）
＊ 解析可能な生物種についてはお問い合わせください。

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納品物

シーケンシング配列データ FastQ形式
GRAS-Di^® 解析ソフトによる解析結果（Excelで閲覧可能な形式）
共優性マーカーの詳細情報（＊）
アンプリコンのマッピング位置情報（＊）
＊ 解析のご対応可能な場合に納品させて頂きます。

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サンプルについて

• gDNA：>30ng/μL、>20μLをお送りください。（規定量に満たない場合はご相談ください）
• 濃度はUVを用いた吸光光度法により測定・ご確認ください。（蛍光測定法による定量はご遠慮ください）
• 冷蔵便もしくは冷凍便にてサンプルをユーロフィンへご送付ください。
• TEへ溶出したgDNAサンプルをご準備ください。

＊ サンプルが規定量に達しない場合はご相談ください。
＊ 電気泳動法などを利用し、RNAのコンタミネーションがないこと、gDNAが分解していないことをご確認ください。
＊ サンプルの送付には、ユーロフィン社にて対応可能な容器をご利用ください。他の形状の容器をご利用いただいた場合には、追加作業が発生するため、納期を変更させていただく場合や追加料金をご請求させていただく場合がございます。予めご了承ください。