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ユーロフィンジェノミクス / ユーロフィンジェノミクス

次世代シーケンス GRAS-Di® 技術によるゲノム解析

コスト良く迅速に、マーカー探索、マーカー選抜、QTL解析、連鎖地図作成等をサポートいたします。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > 次世代シーケンス用ライブラリー作製
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > 次世代データマイニング

サービスについて

概要

ゲノムワイドなジェノタイピング
コスト良く迅速に、マーカー探索、マーカー選抜、QTL解析、連鎖地図作成等をサポートいたします。

GRAS-Di® 技術はトヨタ自動車株式会社にて開発されました。

2回のPCR反応によりゲノムを一様にカバーしたアンプリコンを増幅後、次世代シーケンサーにてシーケンスを行い、独自に開発されたソフトでジェノタイピング解析を行います。

GRAS-Di® はトヨタ自動車株式会社の登録商標です。
GRAS-Di(グラス ディーアイ) Genotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct

特長

  • GBSやRAD-seqに比べて解析領域の偏りが少なく、ゲノム上一様なジェノタイピングが可能。
  • アンプリコン増幅の再現性が非常に高く、ジェノタイプデータの欠損が少ない。
  • ゲノム情報が利用可能な生物種では、アンプリコンマーカーのマッピングとSNP抽出も可能。
  • リファレンス配列が未決定の生物種においても、比較解析を行うサンプルがお手元にあれば、ゲノムワイドなジェノタイピング解析が可能。

サービス内容

ライブラリ調製からシーケンスデータ解析まで

 1. GRAS-Di® ライブラリ調製
  2回のPCR反応によりゲノムを一様にカバーしたアンプリコンを増幅
 2. HiSeq2500によるシーケンス
 3. GRAS-Di® 解析ソフトによるシーケンスデータの解析
  アンプリコンの有無をベースにしたジェノタイピング結果

オプション:ゲノム情報が利用可能な生物種では、バイオインフォマティクスのご相談を承ります。
(アンプリコンマーカーのマッピングやSNP抽出)
* 解析可能な生物種についてはお問い合わせください。
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納品物

シーケンシング配列データ FastQ形式、GRAS-Di® 解析ソフトによる解析結果(Excelで閲覧可能な形式) ページ先頭へ戻る

サンプルについて

  • gDNA:>30ng/μL、>20μLをお送りください。(規定量に満たない場合はご相談ください)
  • 濃度はUVを用いた吸光光度法により測定・ご確認ください。(蛍光測定法による定量はご遠慮ください)
  • 冷蔵便もしくは冷凍便にてサンプルをユーロフィンへご送付ください。
  • TEへ溶出したgDNAサンプルをご準備ください。
* サンプルが規定量に達しない場合はご相談ください。
* 電気泳動法などを利用し、RNAのコンタミネーションがないこと、gDNAが分解していないことをご確認ください。
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ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

製品カタログ・リーフレット

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参考価格・納期

サービス項目 価格 納期
次世代シーケンス GRAS-Di® 技術によるゲノム解析 お問い合わせ お問い合わせ

[価格例]ライブラリー調製から、HiSeq2500シーケンスとGRAS-Di® データ解析まで
例1)イネ、96サンプル、1レーンの場合:¥650,000 1サンプル 約¥6,800
例2)イネ、96サンプル、2レーンの場合:¥1,250,000 1サンプル 約¥6,500

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関連サイト

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※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。