KOTAI バイオテクノロジーズ / KOTAI バイオテクノロジーズ ID: J01929

シングルセル遺伝子発現Flex v2 ID: J01929

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ホルマリン固定した組織や細胞のｍRNAをプローブを用いて検出し、遺伝子発現解析をシングルセルレベルで実施するアプリケーションです。

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サービスについて

概要

シングルセル遺伝子発現Flex v2は、固定した細胞や核にバーコード付きプローブをハイブリダイゼーションさせ、高精度に検出する最新のテクノロジーです。従来のシングルセル解析では困難だった凍結組織やFFPEブロックからの解析はもちろん、壊れやすい細胞やターンオーバーの早い細胞にも柔軟に対応します。また、細胞（Whole Cell）のみならず単離された「核（Nuclei）」の解析にも最適化されており、幅広いサンプル調製プロトコルに適合します。今回のv2アップデートによって、サンプルあたりのコストが下がり、実験条件に合わせた適切なサンプル数を選択しやすくなりました。また、検出感度もさらに向上しています。（fig.1）

fig.1 Fixed RNA プロファイリングの原理

●Singleplex

fig.2 Singleplexのワークフロー

●Multiplex

fig.3 Multiplexのワークフロー

特長

高感度なのに低コストかつ柔軟なMultiplex対応（2-plex～）
凍結組織やFFPEブロックからもシングルセル解析
組織分散等で失われやすい細胞も維持

解析例（KOTAIバイオにて取得したデータ）（fig.4）（fig.5）

Cellrangerによる解析結果をLoupe Browser 8.0で開いたところ。

fig.4 固定組織解析例（マウス大脳）

fig.5 FFPE組織解析例（マウス大脳）

解析可能なサンプル

サンプル	凍結細胞、凍結組織（＊）、固定細胞、固定組織、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプル
動物種	ヒト・マウス・ラット
解析メカニズム	全トランスクリプトームパネルのそれぞれの標的遺伝子に対するプローブを使用して発現遺伝子を検出する
サンプル受け入れ条件	詳細情報ページ参照

＊凍結組織は液体窒素気相保管が推奨されています。-80℃で保管された組織はmRNAの品質が低下します。
　組織の液体窒素保管が難しい場合はあらかじめ固定した上で-80℃で保管することをお勧めします。

納品物

KOTAIバイオテクノロジーズ社がシーケンスを行う場合	Fastqデータ Cell Ranger解析結果 - Web Summary - cloupeファイル - Matrixファイル - csvなど情報シート（解析方法や使用試薬などをまとめたもの）実験情報まとめ（細胞数や生存率cDNAやライブラリの測定結果）
お客様がシーケンスをされる場合	ライブラリー情報シート実験情報まとめ

ご注文に関して

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参考価格・納期

受託内容	価格（税抜）	納期
GEM-X Flex v2（Fixed RNA Profiling）/実験～シーケンス～Cell Ranger解析	基本料金：￥400,000 1plex（ヒト・マウス）/検体：￥200,000 1plex（ラット）/検体：￥250,000 ＊ 2plex以上からラットは対応となります。	6週間

オプション	価格（税抜）
細胞固定	サンプル当たり￥45,000
組織分散（10x試薬固定）	サンプル当たり￥40,000
組織分散（FFPE）	サンプル当たり￥64,000
全血固定（PBMC、白血球）	サンプル当たり￥12,000

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