特長

Thermo Fisher Scientific社のマイクロアレイを用いたSmall RNAの発現解析です。
GeneChip miRNA Array は1アレイで多数の生物種を調べることができ、包括的にSmall RNAをカバーしています。
ヒト、マウス、ラット、イヌ、サルなど、研究および医薬品開発に重要な203種類の生物種を解析することが可能です。
ヒトの核小体低分子RNA（snoRNAおよびscaRNA）も含んでいます。

概要

• サンプルのクオリティチェック（QC）を行います。
• total RNAからターゲットであるmiRNAの3’末端に直接ラベル化（蛍光標識）を行います。
• ハイブリダイゼーションを行い洗浄後、スキャナーにより蛍光を検出を行い蛍光強度を数値化してmiRNA発現解析を行います。

データ解析

発現変動のみられるmiRNAをFold Change比較やT検定、クラスター解析などにより抽出します。
さらに、miRNAが標的とする遺伝子をTargetScanにより予測します。（fig.1）
ターゲットスキャン
miRNAの標的遺伝子の予測プログラムです。
既知のmiRNA-mRNA結合モデルを元に、他のmiRNAがターゲットとする遺伝子の予測を行います。
miRNA解析と遺伝子発現解析を同時にご依頼いただいている場合には、 ターゲットスキャンによりmiRNAデータと遺伝子発現データを連結して、解析を行うこともできます。

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納品物

• Sample QC report（品質検査結果）
• Raw Data（数値データ）
• 解析結果　＊ クラウド経由での納品または記録媒体（CD/DVD）

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サンプルについて

	RNA量	濃度	OD260/280	性状
total RNA	1,000ng以上	125ng/μL以上	1.8〜2.1	RIN値:7.0以上

・サンプル量が上記に満たない場合はお気軽にご相談ください。
・組織、細胞等は、DNA/RNA抽出をご確認いただくか別途お問い合わせください。
・送付方法はサンプル送付方法をご確認ください。