ChIP-seqとは

DNAと転写因子の複合体を抗体で免疫沈降し、沈降したDNA断片をシーケンスすることで、DNAのどの領域が転写因子と相互作用していたのかを明らかにする手法です。

• ゲノム上の転写因子、ヒストン修飾の標的捕捉に
• 疾患や細胞変化に関連する重要な転写因子の定義に
• RNA-seqとの統合解析に

特長

• 丁寧なビフォア・アフターサポート
  15名以上のPh.D.が在籍しており、技術サポート体制に力を入れています。
• 目的に応じたカスタムメイド解析
  基本解析からオーダーメイドの高次解析・統合解析まで幅広く対応します。
• 追加費用ナシ
  データ転送費などの付帯費用はサービス価格に含まれています。

ATAC-seqとの違い

ChIP-seqはATAC-seqと異なり、特定の抗体を用いて免疫沈降を行うことで、特定の転写因子とDNAの相互作用部位を網羅的に明らかにすることが可能です。従い、特定の転写因子やヒストン修飾に興味が定まっている場合に有効な手法となります。

サービスプラン

• 生データプラン
  シーケンスにより取得したfastqデータ（生データ）のみを納品するプランです。
• ベーシック解析プラン
  基本解析を実施するプランです。種々の描画により、個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。
• スタンダード解析プラン
  ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。
• プレミアム解析プラン
  お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うコンサルティングサービスです。
  ＊ プレミアムプランについてはプロジェクトの混雑状況によりお受けできない場合があります。ご了承ください。

解析例（fig.1）（fig.2）（fig.3）

サービスの流れ

シーケンシングは原則として国内外のレリクサ社提携先（Illumina社のService Provider認証取得済み）での実施となります。バイオインフォマティクス解析は全てレリクサ社で実施し、納品いたします。


データ取得からご依頼時の流れ

• データ取得からご依頼いただいた場合、提携先にて⑤サンプルのクオリティチェック（QC）を必ず実施し、QC結果をお客様にご報告いたします。クオリティに問題があった場合は、サンプルの再提出・シーケンスの実施・一部キャンセルの中からお客様にご判断いただきます。
• シーケンスのキャンセルは無償ですが、送付いただいた全てのサンプルがキャンセルとなり、かつサンプルの再提出もない場合は、海外輸送実費をご負担いただきますので、あらかじめご了承ください。尚、QC料金は全てサービス価格に含まれております。

データ解析のみご依頼時の流れ

• お客様自身または他社サービスで解析済みのデータから追加解析をご依頼いただいた場合、どのような情報処理プログラムを用いて解析を実施されたか確認する必要があるため、原則としてデータの事前調査費用が発生いたします。
• 生データからデータ解析のみをご依頼いただいた場合、上記費用は発生いたしません。