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タカラバイオ / タカラバイオ ID: J01746

ロングリードRNA-Seq解析（Iso-Seq） ID: J01746

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ロングリードシーケンサーによる網羅的な全長アイソフォームの検出

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サービスについて

特長

  • ロングリードシーケンサーによるRNA-Seq解析
  • 新規アイソフォームの配列取得、アイソフォームごとの発現解析が可能

概要

PacBioロングリードシーケンサー（パシフィックバイオサイエンス社）を用いて、遺伝子配列の取得を行います。ショートリードのシーケンスでは難しかったアイソフォームの配列決定、アイソフォームごとの遺伝子発現解析にご利用いただけます。

サービス内容

total RNAまたは組織・細胞等のサンプルを提供いただき、ライブラリー作製後、PacBioロングリードシーケンサーを用いてシーケンス解析を行います。得られたシーケンスデータを参照配列に対してマッピングすることで、アイソフォームごとの発現量解析や、新規アイソフォームの検出を行います。

作業の流れ（fig.1）

fig.1 作業の流れ
【オプションサービス】
細胞・組織からのRNA調製

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 解析データ一式（マッピング結果ファイル、発現情報・アノテーション結果ファイル）（fig.2）（fig.3）

fig.2 納品データ例（マッピング結果例）

fig.3 納品データ例（アノテーション結果例）

受入サンプル

  • total RNAなど
    以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

    サンプル量 濃度 液量（目安） 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230
    total RNA（＊1） 1μg以上 100ng/μL以上 10μL以上 1.6以上
    組織・細胞（オプション） お問い合わせ（＊2）

    ＊1 polyA＋ RNAが無い原核生物の解析は別途ご相談ください。
    ＊2 送付サンプルの採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。
    ・RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。
    ・電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
    ・DNase処理を実施してください。
    ・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。
    ・ご希望の作業に応じて、以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
    　 - ご送付いただいたRNAサンプルはアジレント2200 TapeStationなどを用いて検定を行います。
    　　この時点で量・純度が次の作業に十分でない場合はご連絡し、対応方法についてご相談いたします。
    　 - お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、
    　　業務終了後3ヶ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格（税抜） 納期
ロングリードRNA-Seq解析（Iso-Seq） お問い合わせ お問い合わせ

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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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