ファスマック / グライナー・ジャパン ID: J01872

次世代シーケンス イルミナシーケンサーによるカスタム解析 ID: J01872

~イルミナ社の次世代シーケンサーを用いたオーダーメイドな解析~
データ量を増やしたい、ランだけお願いしたいなど、お客様の要望に応じてアレンジいたします。

サービスについて

概要

イルミナ社のMiseq、Nextseqを用いてお客様の実験プランに応じて解析内容を選んでいただくサービスです。
検体数によってはパッケージサービスよりもお得にご利用いただけます。なお、納期は解析内容により変動します。 通常はサンプル到着後1~2ヶ月程度ですが、実際の納期は御見積書をご確認ください。
ご要望であれば、Teams、Zoomなどオンライン会議ツールでのご相談も可能ですので、お気軽にお問い合わせください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期


サンプル調整
【ゲノム用アダプターライブラリ調製】
価格:¥15,000(税抜)
長鎖PCR産物からゲノムDNAまで幅広くご利用いただけるサンプル調製方法です。 ご依頼サンプルに応じて最適な方法を用いてサンプル調製を行います。サンプルによってはDNA抽出もお引き受け可能ですのでご希望の場合にはあわせてご連絡ください。

【アンプリコン解析用のサンプル調製】
作業内容 価格
DNA抽出から 8サンプルまで ¥40,000
9~16サンプル ¥60,000
PCRから 8サンプルまで ¥20,000
9~16サンプル ¥30,000



【RNA-seq用のサンプル調製】
作業内容 価格
RNA抽出(*1) ¥15,000 / サンプル
リボソーム除去(illumina) ¥30,000 / サンプル
ライブラリ調製(illumina) ¥25,000 / サンプル

*1 ファスマック社でノウハウのないものについてはお断りさせていただく場合があります。




illuminaシーケンサーによるラン
①Miseqでのラン
項目 価格
QC(quality control)作業 送付サンプルの濃度・品質 チェック[必須] 16サンプルまで¥30,000
共有解析 2×250 bp 他のお客様のサンプルと相乗りでランを実施(*2) ¥115,000
共有解析 2×300 bp ¥150,000
専有解析 2×250 bp 一人のお客様のサンプルのみでランを実施 ¥330,000
専有解析 2×300 bp ¥450,000


②Nextseqでのラン(*3)
項目 価格
QC(quality control)作業 送付サンプルの濃度・品質 チェック[必須] 16サンプルまで¥30,000
共有解析 2×75 bp 他のお客様のサンプルと相乗りでランを実施(*2) ¥100,000
共有解析 2×150 bp ¥170,000
専有解析 2×75 bp 一人のお客様のサンプルのみでランを実施 ¥270,000
専有解析 2×150 bp ¥450,000

*2 サンプル投入量10% 以上を保証いたします。ただし、データサイズやリード数の保証は行っておりません。 詳細は以下の「解析の結果得られるデータ量について」をご参照ください。
*3 中出力キットの価格となります。高出力キットでの解析をご希望の方は別途ご相談下さい。

<解析の結果得られるデータ量について>
イルミナ社のカタログスペック値では1ランで得られるデータ量は以下の通りとなっております(ペアエンドリード)
【Miseqの場合】(https://jp.illumina.com/systems/sequencing-platforms/miseq/specifications.html
・2×250 bp試薬での解析  7.5~8.5Gb(2,400万~3,000万リード)
・2×300 bp試薬での解析  13.2~15Gb(4,400万~5,000万リード)

【NextSeqの場合】(https://jp.illumina.com/systems/sequencing-platforms/nextseq/specifications.html
・2×75 bp(Mid)試薬での解析  16.25~19.5Gb
・2×150 bp(Mid)試薬での解析  32.5~39Gb *いずれも最大で2億6000万リード

しかしながら、illuminaシーケンサーの解析原理であるSBS(Sequencing By Synthesis)法では解析する配列によって得られるデータ量が変化します。 一般的にはアンプリコン(PCR産物)についてはデータ量が少なくなる傾向にあります。 また、解析時には必ずコントロールとして PhiX ライブラリーをサンプルに応じて10~30 %程度添加します。 このような理由から、グライナー社はデータ量の保証は行っておりません。



③データ解析
データ解析作業の一例は以下の通りです。 その他、パッケージサービスで選択可能な解析オプションもご指定いただけます。
外部取得データ(お手持ちのfastqファイル)を使用したデータ解析にもご利用可能ですので、詳しくはお問い合わせください。
作業内容 価格
アセンブルとコンティグ作成 ¥40,000/サンプル
QIIME等でのデータ解析 ¥1,000/サンプル

【サンプルおよびデータの保管期限】
サンプルおよびデータの保管期限は、パッケージサービスと同様です。

関連サイト