受託オンライン
Commissioned Research Online

受託オンライン
株式会社薬研社

ID: J00527
ID: J00527
コスモ・バイオ / マクロジェン・ジャパン

マイクロアレイ受託解析サービス:microRNA 発現解析

AgilentおよびAffymetrix製のマイクロアレイを用いたmiRNA遺伝子発現解析サービス


カテゴリ
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 遺伝子発現解析・網羅遺伝子解析
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > small RNA・miRNA発現解析
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > メチル化解析
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 変異解析(CGH / CNV Array解析)

サービスについて

概要

AgilentおよびAffimetrixのマイクロアレイを用いたmiRNA発現解析サービスを提供します。Chipは、最新のmiRBaseを基に、随時更新されています。微小胞やFFPEサンプル、血清など様々なサンプルで対応可能です。また、Target mRNAのアノテーションなど、様々な統計的サービスも提供します。

各社アレイの特長

  Agilent affimetrix
対応可能な種 Human、Mouse、Rat及びカスタムチップ 様々な種でご用意しています。
各 miRNA の反復数 20 replicates 9 replicates
特長 ・最新のmiRBaseに対応
・miRBaseにあるすべてのコンテンツでカスタマイズが可能
・miRNA検出、特にqPCR、シーケンシング、その他マイクロアレイのプラットフォームで優れた一貫性
・高い再現性(0.95/inter and intra-lot)
・高感度:130ngのトータルRNAから得られる1.3amolのmiRNA転写産物の80%を検出

解析内容

  • miRNA発現量比較解析(fig.1
    ・標準的な統計解析(Fold change、群平均、SD等)
    ・異なる発現遺伝子の同定(T-test、LPE test、ANOVA等)
    ・多重検定補正(FDR、Bonferroni等)
    ・発現変動miRNAのクラスタリング分析 (階層的クラスタリング、k-平均法等)
  • 標的mRNA分析
    ・miRDBによる予想される標的RNAのアノテーション
    ・miRBaseによるmiRNAの解説
  • カスタム解析(fig.2
    ・統合解析 (mRNA-miRNA、methylation-mRNA、mRNA-CNV 等)

ご送付いただくRNAのQC基準

アプリケーション プラット
フォーム
サンプルタイプ 純度(A260/280)      純度(A260/230)      濃度(ng/uL)    総量(ug)  rRNA比   RIN   その他  
mRNA Expression Agilent GeneExpre トータルRNA >1.5 >1.0 >70ng/uL >0.1 ug >1.0 >7.0 without DNA  
contamination
without
Trizol contamination 
Affymetrix GeneExpression >34ng/uL
miRNA Expression Agilent miRNA トータルRNA >1.5 >1.0 >50ng/uL >0.1 ug >1.0 >7.0 Vsible small RNA peak
Affymetrix miRNA トータルRNA または スモールRNA >17ng/uL >0.13 ug

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

* 解析を含まないサービスのご注文の際は、品番末尾に「W」を入れて下さい(例: MAG-0009W)

プラットフォーム 最低注文サンプル数 価格(税抜) 品番*
解析含む 解析含まない
Agilent miRNA Human、Mouse、Rat SurePrint miRNA Microarrays 8 x 60k 8 ¥613,000 ¥587,000 MAG-0009
Affymetrix miRNA 153 organisms miRNA 3.0Array 1 ¥140,000 ¥137,000 MAG-0104
203 organisms miRNA 4.0Array 1 ¥121,000 ¥117,000 MAG-0105

サンプルがMacrogen社に到着しサンプルQC完了後の標準納期は下記になります。

メーカー 標準納期
解析含む 解析含まない
Agilent 約4週間 約3週間
Affymetrix 約4週間 約3週間

* 繁忙期にチップの在庫がない場合は上記よりも長く納期がかかります。


関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。