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サーモフィッシャーサイエンティフィック / サーモフィッシャーサイエンティフィック ID: J02197

バイオインフォマティクスサービス（カスタムプラグイン） ID: J02197

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既存のソフトウェアではできない解析やレポートを可能にするため、お客様の希望に合わせてプログラムを作成いたします。

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サービスについて

概要

既存のソフトウェアではできない解析やレポートを可能にするため、お客様の希望に合わせてプログラムを作成いたします。

こんな要望をお持ちの方にお勧めです

作業で時間の掛かっている解析作業を自動化したい
コマンド操作が面倒な解析ツールをトレントブラウザで実行したい
Torrent Suite が対応していない生物種を解析したい
オリジナルの解析パイプラインをプラグインとして使用したい

事例紹介

RNASeqAnalysis_TopHat プラグイン

機能	・スプライスジャンクションを考慮したマッピング・遺伝子毎のタグカウント・転写産物構造予測および発現量（RPKM）算出・様々な生物種に対応可能
主な使用ソフトウェア	TopHat2, Bowtie2, HTSeq, Cufflinks

fig.1 要望に応じてリファレンス情報を設定可能

fig.2 解析パイプライン

MethylationAnalysis_Amplicon プラグイン

機能	・バイサルファイト処理DNAを考慮したマッピング・アンプリコン内の各CpGポジション毎のメチル化率を算出・リード毎のメチル化状態を解析して出力
主な使用ソフトウェア	Bismark

fig.3 CpG配列のメチル化解析イメージ

fig.4 出力ファイルをExcelで開いた例

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参考価格・納期

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※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。