1細胞由来の高品質な微生物ゲノムを提供し、次世代の微生物研究をサポートします。
| サンプル | 推奨サンプル量 | 保管条件 |
|---|---|---|
| ヒト糞便 | ≥ 300mg | 凍結糞便、各社メタゲノム解析用保存液懸濁便（冷凍、冷蔵、常温） |
| ヒト唾液 | ≥ 1mL | 市販キット（常温）、冷蔵、各社メタゲノム解析用保存液懸濁唾液 |
| 土壌 | ≥ 20g | 冷蔵 |
| 細胞懸濁液 | ≥ 100μL （濃度：≥ 14,000 cells/μL) |
冷凍、冷蔵（懸濁溶液に合わせて選択） |
| 基本メニュー | 納品物 | 発注可能単位 | 標準納期 | 価格（税抜） |
|---|---|---|---|---|
| シングルセルゲノム解析（標準） 384 well plate, 1 wellに1 cell |
解析レポート・シーケンスデータ | 1サンプル | 8～10週間 | ￥1,000,000/サンプル |
| シングルセルゲノム解析（短期） 384 well plate, 1 wellに1 cell |
解析レポート・シーケンスデータ | 1サンプル | 3～4週間 | ￥1,320,000/サンプル |
シングルセルゲノム解析では、1 plate (384 well) で複数サンプルを解析することも可能です。
その際、 2サンプル（192 wellずつ）の場合は上記単価の1.5倍、4サンプル（96 wellずつ）の場合は上記単価の2倍でお受けいたします。
| オプションメニュー | 概要 | 納品物 | 発注可能単位 | 価格（税抜） |
|---|---|---|---|---|
| オプション 基本料金 |
オプション解析を1項目以上実施する際に 発生する基本料金 |
ー | 1発注 | ￥200,000 |
| ccSAG解析（＊1） | 同一株のSAGを統合し、 冗長性のないドラフトゲノムを作成 ・同一株の同定 ・キメラリード除去 ・アセンブル ・ドラフトゲノム品質評価 ・生物種推定 ・遺伝子推定 |
・解析レポート ・ドラフトゲノム配列 ・遺伝子塩基配列 ・遺伝子アミノ酸配列 ・遺伝子一覧表 |
1サンプル | ￥200,000 |
| 系統樹解析 | ・複数のゲノム配列の系統関係の推定 | ・系統樹図 | 1サンプル（384SAG） | ￥200,000 |
| 生合成遺伝子 クラスター解析 |
・生合成遺伝子クラスターのアノテーション | ・アノテーション結果一覧表 | 1サンプル（384SAG） | ￥200,000 |
| 抗生物質耐性 遺伝子解析 |
・抗生物質耐性遺伝子のアノテーション | ・アノテーション結果一覧表 | 1サンプル（384SAG） | ￥200,000 |
| SAG-MAG 統合解析（＊2） |
シングルセルゲノムとメタゲノムを統合し、 より高品質なドラフトゲノムを構築 ・統合解析 ・ドラフトゲノム品質評価 ・生物種推定 ・遺伝子推定 |
・解析レポート ・ドラフトゲノム配列 ・遺伝子塩基配列 ・遺伝子アミノ酸配列 ・遺伝子一覧表 |
1サンプル | ￥200,000 |
＊1 同株由来と推定されるシングルセルゲノム (Single-cell Amplified Genome(SAG)) を統合し、より高品質のドラフトゲノムを構築します。本手法 ccSAG (Cleaning and Co-assembly of SAG) の詳細は Kogawa et al., 2018 にて報告されています。
＊2 SAG-MAG統合解析は、お客様が発注しbitBiomeで実施したショットガンメタゲノム解析データとの統合の他に、お客様が既にお持ちのショットガンメタゲノムデータからも承ります。ご希望の際は、お問い合わせください。
MAG(Metagenome Assembled Genome:メタゲノムビニング（メタゲノム解析を応用した計算的アプローチで多数の遺伝子断片配列の集合から個別の微生物ゲノムを分別する手法）によって取得されたドラフトゲノム) 。
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※お問い合わせは完了しておりません。
