エスアールエル / エスアールエル(SRL) ID: J01891

次世代シークエンス解析 ID: J01891

サービスについて

全ゲノムシークエンス解析

受付可能サンプル 凍結組織・全血・抽出済みDNA
解析機種 NovaSeqTM 6000 System
ライブラリ調製Kit 機械的なDNA断片化 TruSeqTM DNA PCR-Free
TruSeqTM DNA Nano
酵素によるTagmentation Illumina® DNA PCR-Free Prep
リード長 150bp Paired End
標準取得データ量 90Gb
納品データ Raw Data(fastqファイル)

RNAシークエンス解析

受付可能サンプル 凍結組織・FFPE 組織・細胞・抽出済みRNA
解析機種 NovaSeqTM 6000 System
ライブラリ調製Kit PolyA選択法 Illumina® Stranded mRNA Prep
rRNA除去法 Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ribo-ZeroTM Plus
分解・FFPE RNA 用 Illumina® RNA Prep with Enrichiment
リード長 150bp Paired End
100bp Paired End
標準取得データ量 2,000万ペアリード(4,000万リード)
納品データ ・Raw Data(fastqファイル)
・データ解析(オプション):データQC、カウントデータ、DEG解析、GO解析など応相談

プロテオミクス関連解析(Olink)

ライブラリ調製Kit Olink® Explore 3072
受付可能サンプル 血清 / 血漿
解析機種 NovaSeqTM 6000 System
検出できるタンパク質数 最大2,943種類(Cardiometabolic、Inflammation、Oncology、Neurology)
解析単位 88 samples
納品データ Normalized Protein Expression(NPX)データ(CSV)
ライブラリ調製Kit Olink® Explore HT
受付可能サンプル 血清 / 血漿
解析機種 NovaSeqTM 6000 System
検出できるタンパク質数 最大5,416種類
解析単位 172 samples
納品データ Normalized Protein Expression(NPX)データ(CSV)

マイクロバイオーム解析(16s)

受付可能サンプル 糞便・抽出済みDNA
解析機種 MiSeq® System
PCR増幅領域 V3-V4領域
リード長 250bp Paired End
シーケンスサンプル数 40,000リード
納品データ OTU解析結果(HTMLファイル)

* 上記は一般的な仕様になります。異なる仕様でのシークエンスや核酸抽出や複数施設でのご研究等をご希望の際は、ご相談ください。
* 本検査は研究用です。診断目的に利用することはできません


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