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ユーロフィンジェノミクス / ユーロフィンジェノミクス

次世代シーケンス カスタムアンプリコン解析

多様な種類のアンプリコンに対応したシーケンス解析サービスです。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > 次世代シークエンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > Amplicon Sequence解析

サービスについて

特長(fig.1

  • ゲノムDNA:
    お客様よりご指定頂いたプライマーを用いて、目的の領域をPCR増幅した後、ライブラリ調製を行います。
  • PCR産物:
    アダプター付加に対応(* バーコードの付加には未対応)
  • アンプリコン・ライブラリ:
    お客様にて調製済みのアンプリコン・ライブラリをシーケンスします。

サービス内容(fig.2

  1. 受領したDNAサンプルについて、品質確認(サンプルQC)を行います。
  2. (オプション)ご指定のプライマーを用いて、目的のターゲット領域に対するPCRを行います。
  3. (オプション)PCR産物にアダプターを付加し、ライブラリーを調製します。
  4. 調製したライブラリーをシーケンシングします。
  5. (オプション解析)マッピング・変異候補抽出を行います。
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サンプル条件

サンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

  • ゲノムDNAから始める場合:
    ゲノムDNAを1μg以上(濃度は10ng/μL以上)ご用意ください(*)。
  • PCR産物(アダプター無し)から始める場合:
    プーリングの有り無しに拘らず、1μg以上(濃度は50ng/μL以上)ご用意ください。
  • アンプリコン・ライブラリ(アダプター付き)から始める場合:
    プーリングの有り無しに拘らず、200ng以上(濃度は10ng/μL以上)ご用意ください。
  • 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
  • DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
  • 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
  • 冷蔵もしくは冷凍便にてユーロフィンジェノミクスへ送付してください。
* RNAのコンタミネーションがないことを確認してください(RNase処理を推奨)。 ページ先頭へ戻る

納品物

  • シーケンシング配列データ(Rawデータ):FASTQ形式
  • マッピング・変異候補抽出: bamファイル、vcfファイル
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ご注文に関して

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参考価格・納期

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関連サイト

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※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
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※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。