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株式会社薬研社

ID: J00929
ID: J00929
コスモ・バイオ / マクロジェン・ジャパン

マイクロアレイ受託解析サービス:メチル化解析

illumina社のメチル化アレイを用いた解析サービスです。FFPEサンプルでの実績もあります。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【エピゲノムシーケンス】 > バイサルファイトシーケンス解析

サービスについて

概要

gDNAをご準備いただくだけで、シンプルかつ正確なDNAメチル化解析サービスを提供します。MeDIPプロトコールよりも信頼性の高い、バイサルファイト処理による変換効率を検証することで、メチル化されたシトシンの定量的な結果を得ることができます。マクロジェン社では、イルミナ社の機器を用いた実験系の豊富な経験を生かし、高品質なサービスを提供いたします。

アレイの特長

  Illumina
対応可能な種 Human
使用する製品 Illumina Human methylation 450 Bead Chip
特長
  • 高い再現性(98%以上)
  • 簡単なワークフロー: パワフルなInfinium HDアッセイを用いたPCR-freeプロトコール
  • FFPEサンプルにも対応可能

解析内容

  • メチル化解析(fig.1
    ・標準的な統計解析(Δmean、群平均、SD 等)
    ・異なるメチル化CpGsの同定(T-test、LPE test、ANOVA 等)
    ・多重検定補正(FDR)
    ・DM CpGsのクラスタリング分析(階層的クラスタリング、k-平均法等)

  • 解析例(fig.2)(fig.3)(fig.4

DNAサンプルのQC基準

プラット
フォーム
サンプル
タイプ
QC 条件 その他
純度 (A260/280) 純度 (A260/230) 濃度 (ng/μL) 容量 (μL) 総量 (μg)
illumina ゲノムDNA >1.5 - >70ng/μL >20μL >1.4μg 分解・増幅がないこと

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

* 解析を含まないサービスのご注文の際は、品番末尾に「W」を入れて下さい(例:MAG-0042W)

プラットフォーム 最低注文サンプル数 価格(税抜) 品番(*)
解析含む 解析含まない
illumina Methylation Human HumanMethylation EPIC 8 ¥789,000 ¥766,000 MAG-0042

標準納期
サンプルがMacrogen社に到着しサンプルQC完了後の標準納期は下記になります。

メーカー 標準納期
解析含む 解析含まない
illumina社 約4週間 約3週間

* 繁忙期にチップの在庫がない場合は上記よりも長く納期がかかります。


関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。