T細胞レパトア解析（T細胞受容体多様性解析） ID: J00029

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SMARTテクノロジー / 5’ RACE法とNGSの組み合わせによる網羅的なレパトア解析

カテゴリ

サービスについて

特長

低い増幅バイアスが期待できるSMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2を使用
UMIの利用により、わずか0.001％のクローン型特異的CDR3配列まで高感度に検出可能
比較解析、多様性指標を含む多様な情報解析

サービス内容

供与細胞またはtotal RNAから、TCRα、TCRβ受容体領域についてSMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2を用いてシーケンスライブラリーの調製を行い、次世代シーケンサーを用いて塩基配列を解析します。目的の解析領域に応じて、NovaSeqまたはMiSeqでの解析提案が可能です。得られた塩基配列をもとに多様性の解析を行います。

オプション　サンプル調製
細胞・組織からのRNA調製

納品物

作業報告書
シーケンスデータ一式
解析データ一式

受入サンプル

以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

送付物	サンプル量	濃度	液量（目安）	純度
送付物	サンプル量	濃度	液量（目安）	OD₂₆₀／OD₂₈₀	OD₂₆₀／OD₂₃₀
total RNA （T細胞）	300ng以上	20ng/μL以上	15μL以上	1.6以上
total RNA （全血・組織由来）	3μg以上	150ng/μL以上	20μL以上	1.6以上
組織検体	100mg以上	―	―	―	―
血液検体	全血3mL以上	―	―	―	―

＊対象はヒト由来検体のみとなります。
＊末梢血、組織等にてご依頼の場合は、別途 RNA抽出費用を申し受けます。
＊血液検体の場合、ヘパリンを含む採血管は使用しないでください。
＊組織は採取後速やかに－80℃で保存し、十分な量のドライアイスに入れてタカラバイオへご発送ください。
　迅速な凍結保存が困難な場合は、RNAlaterに浸漬するなど、RNAが分解しないようにして保存してください。

シーケンスライブラリーの作製の際には、サンプル中のT細胞由来のtotal RNA量が重要となります。
末梢血単核細胞以外の検体につきましては、以下の検体中のおよそのT細胞の存在比を目安に必要サンプル量をご準備ください。

検体種別	T細胞の存在比の目安
セルソーター等で単離されたT細胞	>90％
末梢血単核細胞（PBMC）	40～60％
全血	20～40％
リンパ組織	40～60％
その他組織	＜10％

【サンプル送付容器について】
・RNAサンプルは1.5mLチューブでご送付ください。0.5 mlチューブ、PCRチューブ、8連チューブでの提供はご遠慮ください。
　24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

＜推奨プレートおよびシール＞
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates（Eppendorf社, No. EP-0030128.648）
・タイタースティックHCフィルム（WATSON社, No. 547-KTS-HC）

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目	価格（税抜）	納期
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＊ TCRαのみ、TCRβのみの解析も可能です。

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