概要
nCounter
®Analysis System（NanoString Technologies社）は対象核酸をダイレクトにデジタルカウントすることが可能なシステムです。がんや免疫など、特定の分野にフォーカスした遺伝子発現解析サービスをご提供いたします。
- 解析フロー
- Total RNAの品質評価
- 標的核酸とプローブセットのハイブリ
- プローブ複合体のカートリッジへの固定
- 複合体を整列させた後、スキャニング
- コードカウント / 標的ごとにカウントデータ算出
- データ解析（オプション）
特長
- ターゲットとなる核酸を、1分子単位でカウント（ダイレクトデジタルカウント）。
- 従来の手法では核酸の損傷により解析が困難であったFFPE由来サンプルからでも良好な結果を取得可能。
- 高い再現性と定量性から、多くの国際研究や臨床研究で採用（採用論文数4,800以上）。
- 遺伝子発現解析を中心に様々なパネルをご用意。
●本サービスは研究用です。診断目的には使用できません。
サービス内容
- パネル一覧
［遺伝子発現解析＿Oncology Panels］
ヒトとマウスのがん分野にフォーカスしたパネルをご利用いただけます。対象遺伝子などの詳細情報は、NanoString Technologies社のホームページをご参照下さい。（＊ 表中の遺伝子数は、internal reference controlを含む数を示しています。）
ヒト
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Human Tumor Signaling 360™ |
腫瘍シグナル伝達、免疫応答、腫瘍微小環境に関連した遺伝子、腫瘍標的治療開発のためのシグナル伝達経路にフォーカス |
780 |
| Human Breast Cancer 360™ |
乳がんのパスウェイやプロセスに関連した遺伝子およびサブタイプ分類に関連した遺伝子 |
776 |
| Human PanCancer IO 360™ |
がん免疫および腫瘍微小環境に関連した遺伝子 |
770 |
| Human PanCancer Immune Profiling |
がん免疫に関連した免疫応答遺伝子と免疫細胞マーカー |
770 |
| Human PanCancer Pathways |
ドライバー遺伝子を含む主要ながんパスウェイに関連した遺伝子 |
770 |
| PanCancer Progression |
腫瘍の増殖や侵襲性の増加に関与する生物学的プロセスに関連した遺伝子 |
770 |
| Human Metabolic Pathways |
コア代謝プロセスと免疫代謝に関連した遺伝子 |
768 |
| Human CAR-T Characterization |
CAR-T細胞の開発やQCに最適な遺伝子 |
780 |
マウス
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Mouse Tumor Signaling 360™ |
腫瘍シグナル伝達、免疫応答、腫瘍微小環境に関連した遺伝子 |
780 |
| Mouse PanCancer IO 360™ |
がん免疫および腫瘍微小環境に関連した遺伝子 |
770 |
| Mouse PanCancer Immune Profiling |
がん免疫に関連した免疫応答遺伝子と免疫細胞マーカー |
770 |
| Mouse PanCancer Pathways |
ドライバー遺伝子を含む主要ながんパスウェイに関連した遺伝子 |
770 |
| Mouse Metabolic Pathways |
コア代謝プロセスと免疫代謝に関連した遺伝子 |
768 |
［遺伝子発現解析＿Immunology Panels］
ヒトとマウスを中心に、免疫分野にフォーカスしたパネルをご利用いただけます。対象遺伝子などの詳細情報は、NanoString Technologies社のホームページをご参照下さい。（＊ 表中の遺伝子数は、internal reference controlを含む数を示しています。）
ヒト
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Human Autoimmune Profiling |
自己免疫疾患、慢性炎症性疾患および免疫療法の副作用に関連した遺伝子 |
770 |
| Autoimmune Discovery |
9つのタイプの自己免疫疾患に関連した遺伝子および免疫応答遺伝子 |
770 |
| Human Host Response |
感染症に対する免疫応答に関連した遺伝子 |
785 |
| Human Immune Exhaustion |
Immune Exhaustion（免疫細胞の疲弊）に関連した遺伝子 |
785 |
| Human Immunology v2 |
免疫に関連した遺伝子 |
594 |
| Human Inflammation v2 |
炎症に関連した遺伝子 |
255 |
| Human Myeloid Innate Immunity v2 |
自然免疫に関連した遺伝子 |
770 |
ヒト以外の霊長目
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| NHP Immunology |
免疫シグナル伝達経路に関連した遺伝子 |
770 |
マウス
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Mouse Autoimmune Profiling |
自己免疫疾患、慢性炎症性疾患および免疫療法の副作用に関連した遺伝子 |
770 |
| Mouse Host Response |
感染症に対する免疫応答に関連した遺伝子 |
785 |
| Mouse Immune Exhaustion |
Immune Exhaustion（免疫細胞の疲弊）に関連した遺伝子 |
785 |
| Mouse Immunology |
免疫に関連した遺伝子 |
561 |
| Mouse Inflammation v2 |
炎症に関連した遺伝子 |
254 |
| Mouse Myeloid Innate Immunity v2 |
自然免疫に関連した遺伝子 |
754 |
［遺伝子発現解析＿Neuroscience Panels］
ヒトとマウスの神経科学分野にフォーカスしたパネルをご利用いただけます。対象遺伝子などの詳細情報は、NanoString Technologies社のホームページをご参照下さい。（＊ 表中の遺伝子数は、internal reference controlを含む数を示しています。）
ヒト
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Human Neuropathology |
神経変性疾患の発症と進行に関連する遺伝子 |
770 |
| Human Neuroinflammation |
神経炎症（免疫、炎症、神経生物学、神経病理学など）に関連した遺伝子 |
770 |
| Human Glial Profiling |
グリア細胞生物学に関わるパスウェイに関連した遺伝子 |
770 |
| Human AD |
アルツハイマー病の表現型と疾患の進行に関連した遺伝子 |
770 |
マウス
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Mouse Neuropathology |
神経変性疾患の発症と進行に関連する遺伝子 |
770 |
| Mouse Neuroinflammation |
神経炎症（免疫、炎症、神経生物学、神経病理学など）に関連した遺伝子 |
770 |
| Mouse Glial Profiling |
グリア細胞生物学に関わるパスウェイに関連した遺伝子 |
770 |
［遺伝子発現解析＿Stem Cells / Regenerative Medicine Pane］
遺伝子発現解析＿Stem Cells / Regenerative Medicine PaneNanoString Technologies社のホームページをご参照下さい。（＊ 表中の遺伝子数は、internal reference controlを含む数を示しています。）
ヒト
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Human Stem Cell Characterization |
幹細胞生物学に関連した遺伝子、幹細胞の培養過程における評価や機能確認などに使用可能 |
770 |
マウス
| パネル名 |
対象遺伝子 |
遺伝子数（＊） |
| Mouse Stem Cell Characterization |
幹細胞生物学に関連した遺伝子、幹細胞の培養過程における評価や機能確認などに使用可能 |
770 |
- 解析結果
【通常解析】
nSolverTM Analysis Softwareを用いて以下の解析を実施します。
・アッセイQC
・ノーマライゼーション（fig.1）
【オプション解析】
GeneSpring® GXを用いて以下の解析を実施します。
・スキャッタープロットの作成（fig.2）
・発現変動比の算出
・発現変動遺伝子の抽出
・クラスタリング解析+ヒートマップ作成（fig.2）
- 解析例
| 検体数 |
12（＊） |
| パネル |
PanCancer Immune Profiling |
| 機種 |
nCounter FLEX Analysis System |
| データ解析 |
ノーマライゼーション |
| オプション解析 |
発現変動遺伝子の抽出、クラスタリング解析 |
| 納期 |
品質評価通過後、約1ヶ月（オプション解析期間を除く） |
＊ 本サービスは12検体単位にて承ります。
