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株式会社薬研社

ID: J01390
ID: J01390
理研ジェネシス / 理研ジェネシス

nCounter® Analysis

nCounterを用いたターゲット遺伝子発現解析。FFPE由来サンプルからでも良好な結果を取得可能です。


カテゴリ
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 遺伝子発現解析・網羅遺伝子解析
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > デジタルカウント遺伝子発現解析

サービスについて

概要

nCounter ®Analysis System(NanoString Technologies社)は対象核酸をダイレクトにデジタルカウントすることが可能なシステムです。がんや免疫など、特定の分野にフォーカスした遺伝子発現解析サービスをご提供いたします。

  • 解析フロー

    1. Total RNAの品質評価
    2. 標的核酸とプローブセットのハイブリ
    3. プローブ複合体のカートリッジへの固定
    4. 複合体を整列させた後、スキャニング
    5. コードカウント / 標的ごとにカウントデータ算出
    6. データ解析(オプション)

特長

  • ターゲットとなる核酸を、1分子単位でカウント(ダイレクトデジタルカウント)。
  • 従来の手法では核酸の損傷により解析が困難であったFFPE由来サンプルからでも良好な結果を取得可能。
  • 高い再現性と定量性から、多くの国際研究や臨床研究で採用(採用論文数2,600以上)。
  • 遺伝子発現解析を中心に様々なパネルをご用意。

サービス内容

  • パネル一覧

    [遺伝子発現解析_Oncology Panels]
    ヒトとマウスのがん分野にフォーカスしたパネルをご利用いただけます。対象遺伝子などの詳細情報は、NanoString Technologies社のホームページをご参照下さい。(* 表中の遺伝子数は、internal reference controlを含む数を示しています。)

    ヒト
    パネル名 対象遺伝子 遺伝子数(*)
    Human Breast Cancer 360 乳がんのパスウェイやプロセスに関連した遺伝子およびサブタイプ分類に関連した遺伝子 770
    PanCancer IO 360 がん免疫および腫瘍微小環境に関連した遺伝子 770
    PanCancer Immune Profiling がん免疫に関連した免疫応答遺伝子と免疫細胞マーカー 770
    PanCancer Pathways ドライバー遺伝子を含む主要ながんパスウェイに関連した遺伝子 770
    PanCancer Progression 腫瘍の増殖や侵襲性の増加に関与する生物学的プロセスに関連した遺伝子 770
    GX Human Kinase V2 キナーゼ遺伝子 536
    Human Stem Cell 幹細胞に関連した遺伝子 199
    マウス
    パネル名 対象遺伝子 遺伝子数(*)
    Mouse PanCancer IO 360 がん免疫および腫瘍微小環境に関連した遺伝子 770
    PanCancer Mouse Immune Profiling がん免疫に関連した免疫応答遺伝子と免疫細胞マーカー 770
    PanCancer Mouse Pathways ドライバー遺伝子を含む主要ながんパスウェイに関連した遺伝子 770

    [遺伝子発現解析_Immunology Panels]
    ヒトとマウスを中心に、免疫分野にフォーカスしたパネルをご利用いただけます。対象遺伝子などの詳細情報は、NanoString Technologies社のホームページをご参照下さい。(* 表中の遺伝子数は、internal reference controlを含む数を示しています。)

    ヒト
    パネル名 対象遺伝子 遺伝子数(*)
    Human Autoimmune Profiling 自己免疫疾患、慢性炎症性疾患に関連した遺伝子 770
    Human Autoimmune Discovery 9つのタイプの自己免疫疾患に関連した遺伝子および免疫応答遺伝子 770
    GX Human Immunology V2 免疫に関連した遺伝子 594
    Human Inflammation V2 炎症に関連した遺伝子 255
    Human Myeloid Innate Immunity v2 自然免疫に関連した遺伝子 770
    ヒト以外の霊長目
    パネル名 対象遺伝子 遺伝子数(*)
    NHP Immunology 免疫シグナル伝達経路に関連した遺伝子 770
    マウス
    パネル名 対象遺伝子 遺伝子数(*)
    Mouse Autoimmune Profiling 自己免疫疾患、慢性炎症性疾患に関連した遺伝子 770
    GX Mouse Immunology V1 免疫に関連した遺伝子 561
    Mouse Inflammation V2 炎症に関連した遺伝子 254
    Mouse Myeloid Innate Immunity v2 自然免疫に関連した遺伝子 754

    [遺伝子発現解析_Neuroscience Panels]
    ヒトとマウスの神経科学分野にフォーカスしたパネルをご利用いただけます。対象遺伝子などの詳細情報は、NanoString Technologies社のホームページをご参照下さい。(* 表中の遺伝子数は、internal reference controlを含む数を示しています。)

    ヒト
    パネル名 対象遺伝子 遺伝子数(*)
    Neuropathology Human 神経変性疾患の発症と進行に関連する遺伝子 770
    Human Neuroinflammation 神経炎症(免疫、炎症、神経生物学、神経病理学など)に関連した遺伝子 770
    マウス
    パネル名 対象遺伝子 遺伝子数(*)
    Neuropathology Mouse 神経変性疾患の発症と進行に関連する遺伝子 770
    Mouse Neuroinflammation 神経炎症(免疫、炎症、神経生物学、神経病理学など)に関連した遺伝子 770
  • 解析結果

    【通常解析】
    nSolverTM Analysis Softwareを用いて以下の解析を実施します。
    ・アッセイQC ・ノーマライゼーション(fig.1

    【オプション解析】
    GeneSpring® GXを用いて以下の解析を実施します。
    ・スキャッタープロットの作成(fig.2
    ・発現変動比の算出
    ・発現変動遺伝子の抽出
    ・クラスタリング解析+ヒートマップ作成(fig.2
  • 解析例

    検体数 12(*)
    パネル PanCancer Immune Profiling
    機種 nCounter FLEX Analysis System
    データ解析 ノーマライゼーション
    オプション解析 発現変動遺伝子の抽出、クラスタリング解析
    納期 品質評価通過後、約1ヶ月(オプション解析期間を除く)

    * 本サービスは12検体単位にて承ります。


納品物

  • 解析報告書
  • データDVD:カウント生データ(RCCファイル)、リファレンス(RFLファイル)
    ノーマライズされたカウントデータ(CSVファイル)

サンプル条件

サンプルの種類 RNA濃度(*) 溶液量 推奨品質 溶媒
精製Total RNA 20ng/μL以上
(FFPE由来サンプルの場合は60ng/μL以上)
15μL以上 FFPE由来サンプルの場合
300nt以上のRNA断片が50%以上
Nuclease-free水

* サンプルの定量はQubitを用いた方法を推奨しております。


ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
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関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
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