トランスクリプトームとプロテオームを統合解析
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アプリケーション | 納期 | 検体数 | 価格(/検体) (税抜) |
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サンプルの前処理 | タンパク質画分と RNA 画分の分離、精製、QC 提供サンプル:TRIzol (ThermoFisher 社)で懸濁したサンプル(細胞、組織) 必要サンプル量は、各種アプリケーション内の「必要サンプル量」を参照 |
1週間以内 | 1 | ¥30,000 |
アプリケーション | 納期 | 検体数 | 価格(/検体) (税抜) |
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トランスクリプトーム解析 | 3′ RNA-Seq 内容:mRNA の 3′ 末端配列決定 読取リード長:HiSeq 50 bp or NextSeq 75 bp 読取方法:シングルリード ライブラリ調製方法:QuantSeq (Lexogen 社) 取得リード数:100万リード / 検体 必要サンプル量:Total RNA 2μg 以上(40ng/μL以上)、細胞 2 x105 個以上、組織(マウス肝臓 )1 mg 以上 |
8週間 | 1 | ¥63,000 |
2~5 | ¥56,000 | |||
6~8 | ¥51,000 | |||
9以上 | ¥48,000 |
アプリケーション | 納期 | 検体数 | 価格(/検体) (税抜) |
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プロテオーム解析 * サンプル種により検出できるタンパク質数は異なります。 * 参考検出数はHEK293細胞を用いた系での参考値となります。 |
簡易 DIA プロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析 内容:発現タンパク質の同定ならびに相対定量解析 方法:LC-MS/MS(DIA) 参考検出数:2,000~4,000 タンパク質 必要サンプル量:タンパク質 40μg 以上、 細胞 5 x105個 以上、組織 10mg 以上、血清 / 血漿 1μL 以上、 尿 200μL以上 |
4週間 | 1~5 | ¥131,000 |
6~10 | ¥125,000 | |||
11以上 | ¥120,000 | |||
標準 DIA プロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析 内容:発現タンパク質の同定ならびに相対定量解析 方法:LC-MS/MS(DIA) 参考検出数:4,000~6,000 タンパク質 必要サンプル量:タンパク質 40μg 以上、 細胞 5 x105 個 以上、組織 10mg 以上、血清 / 血漿 1μL 以上、 尿 200μL 以上 |
4週間 | 1~5 | ¥216,000 | |
6~10 | ¥207,000 | |||
11以上 | ¥198,000 | |||
高深度 DIA プロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析 内容:Gas phase fraction 法により作製した大規模なプロテイン・ペプチドライブラリーを元にした発現タンパク質の同定ならびに相対定量解析 方法:GPF + LC-MS/MS(ライブラリ作製用)、LC-MS/MS(DIA) 参考検出数:6,000~ 8,000 タンパク質 必要サンプル量:タンパク質 40μg 以上、 細胞 5 x105 個 以上、組織 10mg 以上、血清 / 血漿 1μL 以上、 尿 200μL以上 |
4週間 | 1~5 | ¥320,000 | |
6~10 | ¥307,000 | |||
11以上 | ¥294,000 | |||
標準 DIA リン酸化プロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析 内容 :タンパク質消化物からリン酸化されたペプチドを濃縮し、同定ならびに相対定量解析 方法:LC-MS/MS(DDA、ライブラリ作製用)、LC–MS/MS(DIA、相対定量解析用) 参考検出数:4,000~ 8,000 リン酸化ペプチド断片 必要サンプル量:タンパク質 1mg 以上、細胞 1 x107 個 以上、組織 50mg 以上 |
4週間 | 1~5 | ¥343,000 | |
6~10 | ¥300,000 | |||
11以上 | ¥291,000 | 高深度 DIA リン酸化プロテオーム解析による比較定量解析 内容:リン酸化ペプチドを濃縮後、Gas phase fraction 法により大規模なリン酸化ペプチドライブラリーを作製。そのライブラリーをもとにリン酸化ペプチド同定ならびに相対定量解析 方法:GPF + LC-MS/MS(DDA、ライブラリ作製用)、 LC-MS/MS(DIA、相対定量解析用) 参考検出数:8,000~15,000 リン酸化ペプチド断片 必要サンプル量:タンパク質 1mg 以上、 細胞 1 x107 個 以上、組織 50mg 以上 |
4週間 | 1~5 | ¥457,000 |
6~10 | ¥403,000 | |||
11以上 | ¥379,000 | ゲルバンド中のタンパク質同定 方法:LC-MS/MS(DDA) 必要サンプル量:タンパク質バンドが検出できていれば可能 |
4週間 | 1~5 | ¥96,000 |
6~10 | ¥92,000 | |||
11以上 | ¥88,000 | オプション | クリーナップ処理 タンパク抽出物、体液、培養上清などの液体状のサンプルの場合は必須 |
納期に影響せず | 1 | ¥13,000 |
ヒト血清 / 血漿高存在量タンパク質14種類除去 & クリーナップ処理 必要サンプル量:血清 / 血漿 10μL 以上 |
1 | ¥29,000 | ||
マウス・ラット血清 / 血漿アルブミン・IgG 除去 & クリーナップ処理 必要サンプル量:血清 / 血漿 10μL 以上 |
1 | ¥29,000 | ||
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織からのタンパク質抽出 必要サンプル量:厚さ 10~20μm、表面 50 mm2以上 (ホルマリン固定時間が 48時間以下のサンプルのみお引き受け可能) |
1 | ¥32,000 |
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