生体細胞内における遺伝子やたんぱく質の網羅的解析
| IHC,ISH | NGS | 空間トランスクリプトーム | |
|---|---|---|---|
| 網羅的な解析 | × （特定の標的物質のみ） |
● | ● |
| 組織上の空間分布 | ● | × | ● |
| プラチナコース | スタンダードコース ＊1 | |
|---|---|---|
| パネル | RNAの解析パネル Whole Transcriptome Atlas（ヒト / マウス） Cancer（ヒト / マウス / イヌ） タンパク質解析パネル 免疫（ヒト / マウス） 神経（ヒト / マウス） |
RNAの解析パネル Whole Transcriptome Atlas（ヒト / マウス） |
| 1アッセイ | 4スライド | 1スライド～ |
| ご提出サンプル ＊2 | HEスライド 1枚 未染色スライド（1枚+予備1枚）×検体数 |
HEスライド 1枚 未染色スライド 1枚+予備1枚 |
| 未染色スライド上のROI染色 | PanCK、CD45、Nucleiの他、ご指定のマーカーも可能 Nucleiを含む計4種まで 別途条件検討も実施可能 |
PanCK、CD45、Nucleiのみ |
| 1スライドあたりの解析数（ROI ＊3） | 22か所 | 22か所 |
| 解析及び納品時技術者打ち合わせ | ＜打ち合わせ例＞ ・抗体・条件検討のご提案 ・ROI設定のアドバイス・ご提案 ・詳細データ解析のサポート ・データ内容の詳細説明 |
— （左記ご希望の場合は、費用別途オプション・応相談） |
| 納品 | DCCファイル ROIの位置が入った蛍光画像（PNGファイル） Cluster解析（3比較まで） Volcano作成（3比較まで） |
DCCファイル ROIの位置が入った蛍光画像（PNGファイル） |
| 解析 | Cluster解析（3比較まで） Volcano作成（3比較まで） |
— （左記ご希望の場合は、費用別途オプション・応相談） |
＊1 スタンダードコースは、複数のお客様の検体を同時に解析いたします。
お申込みから3ケ月経過時点でユーロフィンジェネティックラボ社に3スライド以上のお申込みがない場合は自動的にキャンセルとなりますので、必要に応じて再度のお申込みをお願いします。
＊2 HE染色スライドに解析ご指定領域をマーカーしてください（このご指定領域がROIの参考になります）
＊3 ご指定領域・関心領域
| Step.1 | ヒアリング → パネル決定・お申込（＊1） → サンプルご提供 ＊ ご研究目的等をお伺いの上、使用パネルをご提案いたします |
|---|---|
| Step.2 | ROIの選定（＊2） → GeoMx解析 → データ概要ご報告 ＊ HE画像上でROIを指定 ROIの選択方法につきましてはこちらをご覧ください ＊ ROI...「関心領域（Region of Interest、ROI）」 ＊ morphology markerでの免疫染色、ROI指定も可能です（オプション） ＊ GeoMx解析...スライド調製、染色画像取り込み、ROIからのインデックスオリゴ回収、リードアウトを行います 詳細な解析ステップはこちらをご覧ください ＊ ご指定の比較組み合わせ（サンプル間、ROI間、 領域間など）のボルケーノプロット、クラスタリング解析結果をご報告 |
＊1 スタンダードコースの場合、Whole Transcriptome Atlas（ヒト / マウス）のみになります。
＊2 スタンダードコースの場合、打ち合わせは費用別途オプションになります。
| サービス項目 | 価格（税抜） | 納期 |
|---|---|---|
| GeoMxシステムによる空間プロファイリング解析 | ￥1,980,000～ ＊スタンダードコース |
解析開始から35営業日程度～ |
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※お問い合わせは完了しておりません。
