次世代シーケンサーを用いたWhole Transcriptome解析
| サンプル量 | 濃度（目安） | 液量（目安） | 純度 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| OD260/OD280 | OD260/OD230 | ||||
| total RNA | 50ng以上 | 1.7ng/μL以上 100ng/μL以下＊ |
30μL以上＊ | 1.6以上 | |
| cDNA | 5ng以上 | － | 10μL以上 | ||
| 組織・細胞 | 別途ご相談ください | ||||
＊ 短納期プランでは、自動分注機を使用し、プレート単位で作業を実施します。液量調整のため加水処理を実施し作業を行います。
サンプル量・濃度が基準に満たない場合は事前にご相談ください。
・TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit （イルミナ社）での解析を希望の場合は、哺乳類の場合4μg以上、
それ以外の生物種の場合8μg以上のtotal RNAをご提供ください。
・cDNAはSMART-Seq mRNA Kit / SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit / SMART-Seq HT Kit / SMART-Seq Single Cell Kitで増幅した産物を送付ください。
分解の進んだサンプルの場合はSMART-Seq Stranded Kitにて調製したライブラリーをご送付ください。
・RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。
・DNase処理を実施してください。
・サンプル調製時にエタノール沈殿を実施する場合は、共沈剤としてグリコーゲンを添加しないでください。
・電気泳動にてrRNAのバンドが検出され、分解していないことを予めご確認ください。
・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。
| ライブラリー | データ量 | 価格（税抜） | 納期 |
|---|---|---|---|
| ◎mRNA対象（polyA RNA対象） SMART-Seq mRNA＋ Nextera XT DNA Library Prep Kit |
4,000万リード / 検体 | 1～5検体まで：￥225,000 / 一式 6～48検体：￥45,000 / 検体 |
約2週間～ ★短納期 |
| ◎total RNA対象（non polyA RNAも含む） SMART-Seq Stranded Kit ＊ FFPE由来の分解が進んだRNAにも対応 |
6.6億リード | 2検体：￥332,000 4検体：￥404,000 8検体：￥548,000 |
約6～8週間 |
＊ シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
＊ データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。
＊ 上記試薬以外でのライブラリ―作製をご希望の場合は、別途お問い合わせください。
| 検体数 / データ量 | 価格（税抜） | 参考納期 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 4,000万リード / 検体 | 1～48検体 無償 （シーケンス解析に付属しています。） |
追加納期は発生しません。 | 対象生物種： ヒト、マウス ＊ 49検体以上はお問い合わせください。 |
| 16検体 / 6.6億リード | ￥140,000 | ＋10営業日 | 対象生物種：ヒト、マウス以外 |
＊ 既知遺伝子発現解析の価格は、解析に使用する参照配列により変動いたします。
●短納期プランについて
詳細はメーカーサイトにてご確認ください。
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