MS Bioworks / フィルジェン ID: J00636

タンパク質同定解析サービス ID: J00636

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タンパク質をトリプシン消化し、得られたペプチドをLC/MS/MSにより解析

カテゴリ

サービスについて

概要

ペプチドは、質量分析計において断片化され、コンピュータアルゴリズムを用いて、タンパク質配列データベースと一致するMSパターンを取得することで同定されます。感度は、タンパク質1ng未満です。ゲルバンドおよびゲルスポット、または溶液中のタンパク質同定が可能です。ゲルバンドやゲルスポット内のタンパク質同定解析はあらゆるタイプのゲルマトリックスに対応しています。溶液中のタンパク質同定解析の場合、バッファーバックグラウンド（水または揮発性塩など）を含む溶液は、直接トリプシン消化を行うことができますが、より複雑なバックグラウンド（洗剤、不揮発性の塩、グリセロールなど）を含む溶液の場合は、試料分析（溶液の場合）を容易にするための追加のクリーンアップ工程を必要とします。

サービス内容

タンパク質同定解析のワークフロー（fig.1）

fig.1 タンパク質同定解析のワークフロー

配列カバー率（fig.2）（fig.3）

fig.2 配列カバー率：ゲルの場合

fig.3 配列カバー率：溶液の場合

使用機種（fig.4）（fig.5）

fig.4 Thermo Fisher Orbitrap Velos Pro

fig.5 Q Exactive

ご送付サンプルについて

QCシートを同封の上、フィルジェンまでお送り下さい。
発送の際の送料は、お客様負担となります。（着払いは受け取りできませんので、ご注意ください。）
また、土日祝祭日をはさまない様に、フィルジェンの営業日に到着する様にご発送ください。
ご提供頂いたサンプルにつきましては、海外での受託解析であるため、基本的にサンプルのご返却は行っておりませんので、予めご了承ください。

サンプル	輸送温度	ご送付サンプル量
SDS-PAGEバンドまたは2Dゲルスポット対象生物種をご指定ください。	4℃	単一タンパク質において、1ng以上ゲルバンドの大きさは、～1×5mm ゲルスポットの大きさは、～直径2mm
組み換えタンパク質または精製タンパク質溶液対象生物種をご指定ください。	-80℃	総タンパク質濃度 1μg/μLで10μL以上

1.ゲルの場合
ゴム手袋を装着し、クリーン環境下で作業してください。ゲル切り出し後は、1.5mLマイクロチューブへ移し、100μL H2Oに浸漬した状態でお送りください。銀染色の場合は、シルバーステインプラスキット（Bio-Rad）の使用は避けてください。

2.タンパク質溶液の場合
推奨される溶媒は、水または＜50mMの揮発性塩（重炭酸アンモニウムなど）です。界面活性剤、グリセロールおよび不揮発性の塩の使用はできるだけ避けてください。
溶液のクリーンアップが必要な場合は、追加料金が発生する場合がありますので、あらかじめご了承ください。

納品データ

CDまたはDVDにより解析データをご提供いたします。

サンプル情報、作業内容、データの要約を含む解析レポート（PDF形式）

定性および定量的なタンパク質同定データを含んだデータリスト（Excel形式）

独自のデータマイニングが可能な Scaffold ファイル（sf3形式）

＊Scaffoldファイルはフリーソフトウェア「Scaffold Viewer」を用いて閲覧できます。

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス名		数量	価格（税抜）	納期	Cat.#
タンパク質同定解析サービス	ゲル	1サンプルから受注受付	￥63,000/サンプル	約1～1.5ヶ月	F-MSB01-（サンプル数）
タンパク質同定解析サービス	溶液	1サンプルから受注受付	￥109,000/サンプル	約1～1.5ヶ月	F-MSB02-（サンプル数）

＊本サービスは海外業務提携先で実施する解析のため、上記の解析料金のほか、サンプルの海外輸送費が別途発生いたします。

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