日本プロテオミクス / 富士フイルム和光純薬 ID: J00232

nanoLC-MS/MS タンパク質同定サービス ID: J00232

サービスについて

概要

nanoLCを使った MS/MSでは分解能が高く解析速度の早いカラムを使用して超微量のペプチドまで同定できます。BSAを使った解析では銀染色で微かに見える38フェムトモルのバンドも同定いたしました。

SDS-PAGEのゲル断片をお送りいただきますと、ゲル内消化後、nanoLC-MS/MS装置を用いて解析を行い、MascotSearch によるタンパク質同定を行います。最高精度のタンパク質同定をご利用ください。

サービス内容

  • 解析までの流れ(fig.1
    1. サンプル切り出し前の電気泳動写真をお送り下さい。
      解析可否をご連絡させていただきます。
    2. サンプルを4℃にてお送りいただきますと約2週間で解析いたします。
    3. ゲル断片を脱色、システイン残基の還元処理及びアルキル化などを行ったうえで、トリプシンによりゲル内消化を行います。消化されたペプチド断片を抽出し、脱塩処理の後、nanoLC-MS/MSで質量を測定いたします。
    4. Mascot search(MS/MS Ion Search)によりタンパク質を同定します。
    5. 解析結果をメールにて送付いたします。

ご提供いただくもの

  • 解析サンプル
    SDS-PAGE等により得られたゲル断片 (生物種は問いません)
    電気泳動後のゲル(泳動済みゲルからのターゲットバンドの切り出しご依頼時)
    電気泳動用サンプル(ゲル電気泳動~ターゲットバンドの切り出しご依頼時)
  • 解析サンプルに関する情報
    ・ ゲル断片個数
    ・ サンプル由来(生物種)
    ・ 目的タンパク質分子量
    ・ 染色方法および脱色有無
     (MS用の染色キットをご使用ください。また、染色後脱色の有無もご記載ください)
    ・ 架橋剤使用の有無
     (使用の場合は具体的なメーカーとその種類をお教えください)
    ・ 界面活性剤の使用の有無
     (使用の場合は種類とその終濃度をお教えください)
    ・ 膜由来(細胞膜、核膜等)であるか否か
    ・ SDS-PAGE染色画像
     (切り出す前の画像ファイルに解析対象のバンドをご図示ください)

納品物

  • Mascot Search Results(pdf)
  • 同定されたタンパク質に関する付加情報資料(UniProtKB などによる)資料(pdf)
  • 上記データをまとめた資料(Excel)
* QSTAR XL analistQS の生ファイル(AB Sciex社 Analyst QS用wiff形式ファイル)をご希望の場合、予めご相談ください(CD-Rにてご送付いたします)。
* 生物種に関するご希望があれば、お申し付け下さい。
* お手持ちのデータベースによるMascot検索をご希望の場合は、データをご提供下さい。

ご注文に関して

以下のファイルをご利用の上、お問い合わせフォーム からご送付ください。

専用注文書類

参考価格・納期

ゲルから切り出した単一バンドの同定料金
サービス名 検体数 価格(税抜) 納期
nanoLC-MS/MS タンパク同定サービス
アカデミア限定価格(大学・公的研究機関対象)
1~5検体 ¥40,000/検体 サンプル受け取り後約2週間
6検体~ ¥30,000/検体

サービス名 検体数 価格(税抜) 納期
nanoLC-MS/MS タンパク同定サービス 1検体 ¥60,000
(手数料¥10,000含む)
サンプル受け取り後約2週間
2~5検体 ¥50,000/検体
6検体~10検体 ¥40,000/検体
11検体~ ¥30,000/検体

ケラチンのコンタミなどで同定不可の場合、同一検体に限り再解析が可能です。
* 別途費用が発生いたします(¥30,000/検体)
  再解析検体の複数提出の場合は同時提出をお願いいたします。

* 納期は解析が混み合っている場合や、サンプルの解析難易度等によって、標準日程から多少遅れることがございます。
 お急ぎの場合は、可能な限り対応いたしますので、予めご連絡ください。

ゲルから切り出した複数バンドやスメアの一括同定
サービス名 価格(税抜)
免疫沈降サンプルのスメア状
タンパク質の同定
¥60,000 / 分画
(1分画の手数料無料)

* 手数料は1検体のみご依頼の場合に発生致します。
* 1分画=縦横1cmのゲルサイズになります。(複数バンドの場合、合計サイズ1cmで1分画となります)

免疫沈降後のスメア状ゲルから分子量別の分画を作り、それぞれの主要なタンパク質を同定することが可能です。 Scoreは同定したタンパク質の確からしさを表し、Score>30はタンパク質の1個以上のペプチドのアミノ酸配列がデータベースと一致した場合で有意な同定を示します。
* 細胞内タンパク質の網羅的解析ではなく、精製した複数タンパク質の一括同定となります。それぞれのタンパク質が十分に含まれている必要がございます。
(株)プロテオミクスでは免疫沈降後のサンプルでの電気泳動後の主要タンパク質の多数同定実績(1レーンから100以上のタンパク質同定実績)がございます。
* 低濃度のタンパク質がターゲットの場合、1バンド毎の解析をおすすめいたします。


[オプション]
サービス名 検体数 価格(税抜)
泳動済みゲルからのターゲットバンドの切り出し 1ゲル ¥30,000
泳動済みゲルをお送りいただければターゲットバンドの切り出し作業を行います(複数バンド可 )。
ゲル電気泳動~ターゲットバンドの切り出し 1ゲル(~12検体) ¥80,000
泳動予定のサンプルをお送りいただければ、電気泳動、ターゲットバンドの切り出しを行います。
泳動作業完了後、ゲル写真をお送りいたしますので、解析へ進めるターゲットバンドをご選択ください。
ゲル電気泳動で作業を終了する場合、作業費用50,000 円 検体をご請求させていただきます。

*手数料は1検体のみご依頼の場合に発生致します。



[再解析・追加解析]
サービス名 検体数 価格(税抜き)
再解析(同一検体の再提出 ) 1検体 ¥30,000
追加解析(解析済み検体の別データベースので解析) 1検体 ¥10,000

[実験サポート体制]
  • 免疫沈降実験
    免疫沈降可能な抗体の選び⽅、細胞エキストラクトの調整⽅法、核・ミトコンドリアエキストラクトの調整⽅法、免疫沈降の作業内容のご相談・作業実施
  • 組換えタンパク質を⽤いたin vitro screening
    組換えタンパク質の精製とそれを⽤いたin vitro screening等の⽣化学実験のご相談・作業実施
  • その他の必須の技術
    電気泳動、免疫沈降物のnano LC-MS/MS質量分析による同定、ウエスタンブロッティング、ファーウエスタンブロッティングによる相互作⽤の検定のご相談・作業実施

  • サービス名 検体数 価格(税抜き)
    細胞抽出液の準備と免疫沈降 1検体 ¥80,000 / 検体
    2検体目~ ¥40,000 / 検体
    電気泳動・銀染色 1式 ¥50,000 / 式

    納期は実験の種類にもよりますが、サンプル受領後、2ヶ月以内に解析結果をご報告しております。

関連サイト