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マクロジェン・ジャパン / マクロジェン・ジャパン ID: J00645

PacBio Sequel IIe / Revioシーケンス解析 ID: J00645

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PacBio Sequel IIe / Revioを用い、正確で長いリードを得る解析を行います。

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サービスについて

概要

  • 多様な研究に貢献するロングリードシーケンス
    PacBio Sequel IIe / Revioは、CCS read（HiFi）により これまでと比べて長いリードかつ正確性の高いデータを得ることができる次世代シーケンサーです。得られるロングリードシーケンスデータは、 De novo全ゲノムシーケンスのアセンブルを容易にするだけでなく、 ゲノムの構造解析、転写産物のアイソフォーム同定などにも貢献します。
  • ロングリードを実現する一分子リアルタイム（SMRT® ）技術
    本シーケンサーは、一分子リアルタイム（SMRT® ）技術を採用しています。SMRT技術では、リン酸および蛍光色素が結合した核酸を用いることで、自然なDNA合成反応を蛍光検出します。DNA合成反応は、SMRTセル上に搭載された数千個にもわたるZero-Mode Waveguides（ZMWs）内で行われます。ZMWs内には一分子のDNAポリメラーゼが固定されており、DNAポリメラーゼとテンプレートの複合体の固定面にのみ光を当て、蛍光を検出します。これにより、一分子レベルのシーケンスが可能となります。
  • 幅広いGC含量のサンプルに対応
    従来のシーケンサーとは異なり、SMRT技術はPCR増幅を介さないため、 幅広いGC含量のゲノムDNAに対応しています。
  • ショートリードとロングリードを駆使したマクロジェン・ジャパンの全ゲノム解析
    マクロジェングループが保有する、多様なショートリード / ロングリードシーケンサーを使用することにより、多様な生物の全ゲノム解析に最適なソリューションを提供致します。これまで全ゲノム解析が困難であった生物種についても、ぜひご相談ください。

PacBio社 シーケンサー

シーケンサー Run scale（Sequencing Mode） 1セルあたりの読み取り数（Reads） 対応　Library 解析プラン アプリケーション
Sequel Ⅱ e 該当なし
（HiFi only）		 2～6Million 【3.0】PacBio HiFi Library ・相乗り（WGSのみ）
・cell買取		 ・全ゲノムシーケンス解析（WGS）
・トランスクリプトーム（Iso-Seq）
・16sメタゲノム（16s full length-Seq）
・Amplicon-Seq
・Library-Seq
【3.0】PacBio Microbial Library
【3.0】PacBio Amplicon Library
【3.0】PacBio 16s full-length Library
【3.0】PacBio Iso-Seq Library
Revio 該当なし
（HiFi only）		 ～25Million 【3.0】PacBio HiFi Library ・cell買取 ・全ゲノムシーケンス解析（WGS）
・Library-Seq

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参考価格・納期

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  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
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